RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D.

2018

• ToTem: a tool for variant calling pipeline optimization

  TOM Nikola TOM O. MALČÍKOVÁ Jitka PAVLOVÁ Šárka KUBEŠOVÁ Blanka RAUSCH T. KOLARIK M. BENES V. BYSTRÝ Vojtěch POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Článek v odborném periodiku

  BMC Bioinformatics, rok: 2018, ročník: 19, vydání: JUN, DOI

• Transcription factor YY1 can control AID-mediated mutagenesis in mice

  ZÁPRAŽNÁ Kristína BASU A. TOM Nikola JHA V. HODAWADEKAR S. RADOVÁ Lenka MALČÍKOVÁ Jitka TICHÝ Boris POSPÍŠILOVÁ Šárka ATCHISON M.L.

  Článek v odborném periodiku

  EUROPEAN JOURNAL OF IMMUNOLOGY, rok: 2018, ročník: 48, vydání: 2, DOI

2017

• Analýza genetických změn CLL nemocných s vývojem resistence k léčbě inhibitorem BTK

  JAROŠOVÁ Marie KOTAŠKOVÁ Jana PLEVOVÁ Karla MALČÍKOVÁ Jitka BRYCHTOVÁ Yvona ONDRUŠKOVÁ E. ĎURECHOVÁ E. DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• B cell receptor signaling actvity is associated with genomic defects in chronic lymphocytic leukemia

  OLBERTOVÁ Helena PLEVOVÁ Karla MALČÍKOVÁ Jitka KOTAŠKOVÁ Jana BYSTRÝ Vojtěch MANČÍKOVÁ Veronika LOJA Tomáš TRBUŠEK Martin ŠPUNAROVÁ Michaela BRYCHTOVÁ Yvona DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• Biallelic TP53 gene mutations due to copy-neutral loss of heterozygosity and monoallelic mutations in absence of 17p deletion occur in CLL with comparable frequency

  PLEVOVÁ Karla MALČÍKOVÁ Jitka PAVLOVÁ Šárka KOTAŠKOVÁ Jana POPPOVÁ Lucie ŠMARDOVÁ Jana DIVÍŠKOVÁ Eva ĎURECHOVÁ Kristina OLTOVÁ Alexandra BRYCHTOVÁ Yvona PANOVSKÁ Anna DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• Complex analysis of the TP53 tumor suppressor in mantle cell and diffuse large B-cell lymphomas

  ZLÁMALÍKOVÁ Lenka MOULIS Mojmír RAVČUKOVÁ Barbora LIŠKOVÁ Květoslava MALČÍKOVÁ Jitka ŠÁLEK David JARKOVSKÝ Jiří SVITÁKOVÁ Miluše HRABÁLKOVÁ Renata ŠMARDA Jan ŠMARDOVÁ Jana

  Článek v odborném periodiku

  Oncology Reports, rok: 2017, ročník: 38, vydání: 4, DOI

• Complex genome rearrangements are associated with altered gene expression in chronic lymphocytic leukemia.

  PLEVOVÁ Karla HYNŠT Jakub BYSTRÝ Vojtěch MALČÍKOVÁ Jitka PÁL Karol RAUSCH T. BENEŠ V. DOUBEK Michael POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• Dopad rekurentních mutací na dobu do progrese po terapiích zahrnujících rituximab v 1. linii u pacientů s CLL.

  HLOŽKOVÁ Michaela MALČÍKOVÁ Jitka TOM Nikola BORSKÝ Marek BRYCHTOVÁ Yvona DOUBEK Michael PANOVSKÁ Anna DIVÍŠKOVÁ Eva MRÁZ Marek POSPÍŠILOVÁ Šárka MAYER Jiří TRBUŠEK Martin

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• GLASS

  PÁL Karol BYSTRÝ Vojtěch REIGL Tomáš DEMKO Martin KREJČÍ Adam TOULOUMENIDOU T. STALIKA E. TICHÝ Boris GHIA P. STAMATOPOULOS K. POSPÍŠILOVÁ Šárka MALČÍKOVÁ Jitka DARZENTAS Nikos

  Software

  Rok: 2017

• GLASS: assisted and standardized assessment of gene variations from Sanger sequence trace data

  PÁL Karol BYSTRÝ Vojtěch REIGL Tomáš DEMKO Martin KREJČÍ Adam TOULOUMENIDOU T. STALIKA E. TICHÝ Boris GHIA P. STAMATOPOULOS K. POSPÍŠILOVÁ Šárka MALČÍKOVÁ Jitka DARZENTAS Nikos

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2017, ročník: 33, vydání: 23, DOI