doc. RNDr. David Svoboda, Ph.D.

2019

• CytoPacq: A web-interface for simulating multi-dimensional cell imaging

  WIESNER David SVOBODA David MAŠKA Martin KOZUBEK Michal

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2019, ročník: 35, vydání: 21, DOI

• On Generative Modeling of Cell Shape Using 3D GANs

  WIESNER David NEČASOVÁ Tereza SVOBODA David

  Článek ve sborníku

  Image Analysis and Processing – ICIAP 2019, rok: 2019

• The role of RNA Polymerase II contiguity and long-range interactions in the regulation of gene expression in human pluripotent stem cells.

  EISELLEOVÁ Lívia LUKJANOV Viktor FARKAŠ Šimon SVOBODA David ŠTĚPKA Karel KOUTNÁ Irena

  Článek v odborném periodiku

  Stem Cells International, rok: 2019, ročník: 2019, vydání: Article ID 1375807, DOI

• Toward Robust Fully 3D Filopodium Segmentation and Tracking in Time-Lapse Fluorescence Microscopy

  MAŠKA Martin NEČASOVÁ Tereza WIESNER David SOROKIN Dmitry PETERLÍK Igor ULMAN Vladimír SVOBODA David

  Článek ve sborníku

  26th IEEE International Conference on Image Processing, rok: 2019

• Visual and Quantitative Comparison of Real and Simulated Biomedical Image Data

  NEČASOVÁ Tereza SVOBODA David

  Článek ve sborníku

  Computer Vision – ECCV 2018 Workshops, rok: 2019

2018

• ADC mapy ve vztahu k peritumorózní buněčné infiltraci u glioblastomu

  SOLÁR Peter MACKERLE Zdeněk VALEKOVÁ Hana HERMANOVÁ Markéta HENDRYCH Michal JANČÁLEK Radim SVOBODA David

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• FiloGen: A Model-Based Generator of Synthetic 3-D Time-Lapse Sequences of Single Motile Cells with Growing and Branching Filopodia

  SOROKIN Dmitry PETERLÍK Igor ULMAN Vladimír SVOBODA David NEČASOVÁ Tereza MORGAENKO Katsiarina EISELLEOVÁ Lívia TESAŘOVÁ Lenka MAŠKA Martin

  Článek v odborném periodiku

  IEEE Transactions on Medical Imaging, rok: 2018, ročník: 37, vydání: 12, DOI

• Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Multiple Mutually Interacting Motile Cells with Filopodia

  PETERLÍK Igor SVOBODA David ULMAN Vladimír SOROKIN Dmitry MAŠKA Martin

  Článek ve sborníku

  Simulation and Synthesis in Medical Imaging, rok: 2018

• Tubular Network Formation Process Using 3D Cellular Potts Model

  SVOBODA David NEČASOVÁ Tereza TESAŘOVÁ Lenka ŠIMARA Pavel

  Článek ve sborníku

  Simulation and Synthesis in Medical Imaging, rok: 2018

2017

• An objective comparison of cell-tracking algorithms

  ULMAN Vladimír MAŠKA Martin MAGNUSSON Klas E G RONNEBERGER Olaf HAUBOLD Carsten HARDER Nathalie MATULA Pavel MATULA Petr SVOBODA David RADOJEVIC Miroslav SMAL Ihor ROHR Karl JALDÉN Joakim BLAU Helen M DZYUBACHYK Oleh LELIEVELDT Boudewijn XIAO Pengdong LI Yuexiang CHO Siu-Yeung DUFOUR Alexandre C OLIVO-MARIN Jean-Christophe REYES-ALDASORO Constantino C SOLIS-LEMUS Jose A BENSCH Robert BROX Thomas STEGMAIER Johannes MIKUT Ralf WOLF Steffen HAMPRECHT Fred A ESTEVES Tiago QUELHAS Pedro DEMIREL Ömer MALMSTRÖM Lars JUG Florian TOMANCAK Pavel MEIJERING Erik MUNOZ-BARRUTIA Arrate KOZUBEK Michal ORTIZ-DE-SOLORZANO Carlos

  Článek v odborném periodiku

  Nature Methods, rok: 2017, ročník: 14, vydání: 12, DOI