doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.

2013

• R/Bioconductor package for identification of triplex-forming sequences

  HON Jiří LEXA Matej MARTÍNEK Tomáš RAJDL Kamil

  Software

  Rok: 2013

• Triplex: an R/Bioconductor package for identification and visualization of potential intramolecular triplex patterns in DNA sequences

  HON Jiří MARTÍNEK Tomáš RAJDL Kamil LEXA Matej

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2013, ročník: 29, vydání: 15, DOI

2012

• Classification of Pseudomonas spp. isolated from Antarctic samples

  KOSINA Marcel BARTÁK Miloš MAŠLAŇOVÁ Ivana PASCUTTI Andrea ŠEDO Ondrej LEXA Matej SEDLÁČEK Ivo

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2012, druh: Další prezentace na konferencích

• cswHMM: a novel context switching hidden Markov model for biological sequence analysis

  BYSTRÝ Vojtěch LEXA Matej

  Článek ve sborníku

  Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms., rok: 2012

• Prediction of significant cruciform structures from sequence in topologically constrained DNA - a probabilistic modelling approach

  LEXA Matej NEJEDLÝ Karel NAVRÁTILOVÁ Lucie BRÁZDOVÁ Marie

  Článek ve sborníku

  Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms., rok: 2012

2011

• A dynamic programming algorithm for identification of triplex-forming sequences

  LEXA Matej MARTÍNEK Tomáš BURGETOVÁ Ivana KOPEČEK Daniel BRÁZDOVÁ Marie

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2011, ročník: 27, vydání: 18, DOI

• Architecture Model for Approximate Tandem Repeat Detection

  MARTÍNEK Tomáš LEXA Matej

  Článek ve sborníku

  22nd IEEE International Conference on Application-specific Systems, Architectures and Processors, rok: 2011

2010

• Clustering of Protein Substructures for Discovery of a Novel Class of Sequence-Structure Fragments

  RUDOLFOVÁ Ivana ZENDULKA Jaroslav LEXA Matej

  Článek ve sborníku

  ITBAM 2010 (Information Technology in Bio- and Medical Informatics), LNCS 6266, rok: 2010

• Clustering Techniques for Protein Fragments Analysis

  BURGETOVÁ Ivana ZENDULKA Jaroslav LEXA Matej

  Odborná kniha

  Rok: 2010, počet stran: 102 s.

• Hardware Acceleration of Approximate Tandem Repeat Detection

  MARTÍNEK Tomáš LEXA Matej

  Článek ve sborníku

  18th IEEE Symposium on Field-Programmable Custom Computing Machines, rok: 2010