Informace o projektu
Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
- Kód projektu
- MSM0021622413
- Období řešení
- 1/2005 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- proteiny, vztah struktury a funkce proteinů, komplexy proteinů, proteom, metabolom
Návrh bezprostředně navazuje na předchozí výzkumný záměr "Strukturně funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu", řešený v letech 1998-2004, a zčásti i na projekt "Laboratoř struktury a dynamiky biomolekul" v rámci programu "250" (1996-2000). Klíčovou součástí tohoto výzkumného záměru byla identifikace a charakterizace vybraných bakteriálních proteinů a nízkomolekulárních látek účastnících se metabolismu bakterií a hub. Nově navrhovaný záměr by měl jednak zahrnout i další proteiny z jiných typů organismů, např. živočišné proteiny vážící feromony, ale hlavním přínosem bude rozšíření předmětu zájmu na interakce proteinů s okolím. Řečeno jinak, hlavní inovací bude to, že předmětem zájmu budou komplexy proteinů. Při studiu funkce a regulace enzymů se zaměříme i na rozvoj metod monitorování jejich aktivity za podmínek in vivo analýzou intracelulárních metabolitů. Zapojení odborníků z oblasti instrumentální analytické chemie a experimentální organické chemie a fotochemie umožní neomezovat se na, z pohledu řady metod, „uživatelský přístup“, ale vyvíjet vlastní aktivity k dalšímu rozvoji a implementaci těchto technik v proteomice a metabolomice. Nový záměr bude moci stavět na instrumentální základně, kterou se v minulém období podařilo výrazně posílit. Např. v letech 2001-2002 bylo sdružením prostředků z fondu SZNN MŠMT, minulého výzkumného záměru a grantu GAČR vybudováno moderní pracoviště pro analýzu proteomu, zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu, denzitometrii s analýzou obrazu a hmotnostní spektrometrii proteinů. Vynikající je také strukturní a počítačové zázemí projektu, a to jak z hlediska instrumentálního tak z hlediska lidských zdrojů. Výrazně byla inovována molekulárně biologická infrastruktura záměru (např. zřízena nová laboratoř pro studium interakce rostlin s patogeny). Těmito změnami se otevírá pole využití moderních metod genomiky, proteomiky a metabolomiky při akcentaci biochemického a strukturního pohledu na řešenou problematiku. Celková hodnota investičních zařízení, která budou v rámci řešení výzkumného záměru používána, přesahuje částku 100 mil. Kč. Investiční úsilí podávaného výzkumného záměru bude sledovat základní myšlenku udržet alespoň rámcově krok v oblasti instrumentace používané v té části současné moderní biochemie a strukturní biologie, která se zabývá proteiny. K základním cílům výzkumného záměru v oblasti personální bude udržet na fakultě mladé kvalitní výzkumné pracovníky, kteří buď byli fakultou vychováni či na fakultu přišli v rámci vládních programů na posílení výzkumu na vysokých školách či výzkumných center.
Publikace
Počet publikací: 836
2010
-
Influence of the Acetylcholinesterase Active Site Protonation on Omega Loop and Active Site Dynamics
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics, rok: 2010, ročník: 28, vydání: 3
-
Interaction between Bacterial Lectins and Host Carbohydrates: Strategies for High Affinity Binding
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Interpretation of Indirect Nuclear Spin_Spin Couplings in Isomers of Adenine: Novel Approach to Analyze Coupling Electron Deformation Density Using Localized Molecular Orbitals
The Journal of Physical Chemistry A, rok: 2010, ročník: 114, vydání: 24
-
Lectin from Chromobacterium violaceum - role of water molecule in the carbohydrate binding site
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Lectins from Burkholderia cenocepacia - potential virulence factors
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Lectins from pathogens: mystery of life
Rok: 2010, druh: Vyžádané přednášky
-
Magnetic Resonance: 15N NMR Applications
Encyclopedia of Spectroscopy and Spectrometry (Second Edition), vydání: Vyd. 2nd Edition, rok: 2010, počet stran: 7 s.
-
MEASUREMENT OF Zn, Cd AND Cu IN STREPTOMYCES CELLS USING DIFFERENTIAL PULSE VOLTAMMETRY
X. pracovní setkání fyzikálních chemiků a elektrochemiků - sborník příspěvků, rok: 2010
-
Metabolic changes in sulfur- and iron-oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans
Rok: 2010, druh: Konferenční abstrakty
-
Method of detoxication of yperite by using haloalkane dehalogenases
Vydavatel: Patentový úřad Austrálie, stát vydání: Austrálie, číslo patentu: AU 2006254625 B2, rok: 2010