Rozdíly ve struktuře genomu u vybraných zástupců rodu Treponema.

• Autoři: STROUHAL Michal; MIKALOVÁ Lenka; MATĚJKOVÁ Petra; ŠMAJS David
• Rok publikování: 2008
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Rod Treponema zahrnuje zástupce s různou mírou invazivity a patogenity. T. pallidum subsp. pallidum je etiologickým agens sexuálně přenosné syfilis a je obligátním patogenem člověka. Endemické nevenerické treponemální infekce tropických a subtropických oblastí vyvolávají T. pallidum subsp. pertenue (způsobující yaws) a T. pallidum subsp. endemicum (způsobující endemickou syfilis). Blízce příbuzný druh T. paraluiscuniculi způsobuje venerické onemocnění králíků a není infekční pro člověka. Genomy 9 zástupců zahrnující kmeny Mexico A, Street strain 14, DAL-1 (T. p. pallidum), Samoa D, Gauthier, CDC-2 (T. p. pertenue), Bosnia A (T. p. endemicum), Fribourg-Blanc (taxonomicky blíže nespecifikovaný opičí izolát) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi) byly porovnány pomocí metody whole genome fingerprinting (WGF) s genomem kmene Nichols (T. p. pallidum), jehož komletní nukleotidová sekvence je známa. Získané restrikční profily byly použity k determinaci heterologních úseků DNA jednotlivých treponemálních kmenů. U kmenů Mexico A, DAL-1, Gauthier, CDC-2, Fribourg-Blanc bylo zatím analyzováno 71 % genomu, u kmene Bosnia A 46 %.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum