Ing. Katarína Grešová

2024

• 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Year: 2024, type:

• 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Year: 2024, type:

• 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Year: 2024, type:

• AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  GREŠOVÁ Katarína ŠPRINGEROVÁ Pavlína SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Conference abstract

  Year: 2024, type: Conference abstract

• AlphaFind — discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína ČILLÍK Jakub JÁNOŠOVÁ Miriama PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Conference abstract

  Year: 2024, type: Conference abstract

• AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Year: 2024

• AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš GREŠOVÁ Katarína OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav ROŠINEC Adrián ANTOL Matej

  Year: 2024, type:

• AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Article in Periodical

  Nucleic acids research, year: 2024, volume: 52, edition: July 5, DOI

• Fast, structure-based searching in a large-scale protein data repository

  SLANINÁKOVÁ Terézia GREŠOVÁ Katarína PROCHÁZKA David SPIŠAKOVÁ Viktória ROŠINEC Adrián ČILLÍK Jakub ŠPRINGEROVÁ Pavlína KŘENEK Aleš DOHNAL Vlastislav SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

  Conference abstract

  Year: 2024, type: Conference abstract

• GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Year: 2024, type: