Project information
Použití elektromigračních technik jako užitečného nástroje pro identifikaci mikroorganismů a jejich zavedení do praktické výuky Ústavu biochemie př.f. MU

Pro separaci biočástic, včetně mikroorganizmů, se jeví v posledních několika letech slibné použití kapilárních elektroforetických technik. V našem projektu se proto zaměříme na vypracování praktické úlohy věnované využití elektromigračních technik při studiu bakterií Pseudomonas syringae a jejich dalších vlastností, které by byly přínosné pro jejich rychlou separaci a identifikaci. Pro separaci bakterií bude použita technika kapilární zónová elektrophoresa (CZE) a kapilární isoelektrické fokusace (cIEF) s optickou detekcí. Bakterie Pseudomonas syringae pathovars se odlišují i svým proteomickým složením. Proto budou separovány lyzáty těchto bakterií pomocí isoelektrické fokusace (IEF). Bude optimalizována separace lyzátů bakterií a zjišťovány rozdíly mezi separacemi, tzn. budou porovnávány jejich fingerprinty. Výsledkem bude jednoduchá, časově nenáročná technika využitelná pro stanovení poddruhu Pseudomonas syringae pathovars (sbírkové kmeny P. s. pv. lachrymans, maculicola, morsprunorum, tomato, mori a persicae), která bude porovnána s běžně používanou metodou plynové chromatografie. Dále se zaměříme na studium bakterie Pseudomonas syringae pv. syringae, zda má vliv na jejich pI doba kultivace a porovnání jejich pI podle typů rostlin na kterých se vyskytují.