Project information
INBIOR - Internacionalizace programu Strukturní biologie s důrazem na rozvoj nových směrů výzkumu
(INBIOR)
- Project Identification
- CZ.1.07/2.3.00/20.0042 (kod CEP: EE2.3.20.0042)
- Project Period
- 10/2011 - 9/2014
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
- Operational Programme Education for Competitiveness
- 2.3 Human resources in research and development
- MU Faculty or unit
-
Central European Institute of Technology
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Mgr. Veronika Papoušková, Ph.D.
Cílem projektu je přispět k rozvoji lidských zdrojů pro vybrané prioritní a nově budované výzkumné směry programu Strukturní biologie a k jejich lepší integraci do Evropského výzkumného prostoru. Projekt se zaměřuje především na posílení výzkumných týmů v oblastech NMR spektroskopie, kryoelektronové mikroskopie a bioinformatiky. Hlavními nástroji pro splnění uvedeného záměru projektu jsou:
1) Hostování a reintegrace dvou klíčových vědců ze zahraničí, potenciálních vedoucích výzkumných skupin (Peter Lukavský, University of Cambridge, UK; Lukáš Trantírek, Utrecht University, Nizozemí),
2) Posílení a nasměrování stávajících výzkumných skupin a jejich doplnění o převážně zahraniční postdoktorandy (Václav Veverka, University of Leicester, UK; a další)
3) Podpora mezinárodní integrace, spolupráce a mezinárodní mobility včetně pořádání odborných akcí s mezinárodní účastí na Masarykově univerzitě
4) Další vzdělávání lidských zdrojů ve VaV v oblastech nesouvisejících s vědeckým oborem
Publications
Total number of publications: 20
2020
-
Staufen1 reads out structure and sequence features in ARF1 dsRNA for target recognition
Nucleic acids research, year: 2020, volume: 48, edition: 4, DOI
2016
-
Efficient large-scale preparation and purification of short single-stranded RNA oligonucleotides
Biotechniques, year: 2016, volume: 60, edition: 2, DOI
-
NMR solution structure determination of large RNA-protein complexes
PROGRESS IN NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE SPECTROSCOPY, year: 2016, volume: 97, edition: November, DOI
-
Spectral density mapping at multiple magnetic fields suitable for C-13 NMR relaxation studies
Journal of Magnetic Resonance, year: 2016, volume: 266, edition: May, DOI
2015
-
High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications
Journal of Cheminformatics, year: 2015, volume: 7, edition: DEC, DOI
-
How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pK(a) Prediction?
Journal of Chemical Information and Modeling, year: 2015, volume: 55, edition: 6, DOI
-
ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank
Nucleic Acids Research, year: 2015, volume: 43, edition: D1, DOI
2014
-
A Novel Protein-Protein Interaction in the RES (REtention and Splicing) Complex
Journal of Biological Chemistry, year: 2014, volume: 289, edition: 41, DOI
-
Boronic acids for sensing and other applications - a mini-review of papers published in 2013
Chemistry Central Journal, year: 2014, volume: 8, edition: OCT 18 2014, DOI
-
Combining ferrocene, thiophene and a boronic acid: a hybrid ligand for reagentless electrochemical sensing of cis-diols
Tetrahedron Letters, year: 2014, volume: 55, edition: 21, DOI