Project information
Molekulární charakterizace B buněčných receptorů a jejich vztah k evoluci genetických změn u chronické lymfocytární leukémie
- Project Identification
- NT13493-4/2012 (kod CEP: NT13493)
- Project Period
- 4/2012 - 12/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
University Hospital Brno-Bohunice
Na variabilním průběhu chronické lymfocytární leukémie (CLL) se podílí řada faktorů. K významným patří signalizace B buněčnými receptory (BCR), jejíž intenzita závisí na molekulárních vlastnostech BCR. Výsledkem je variabilní proliferační potenciál maligních buněk ovlivňující heterogenní akumulaci genetických změn. V rámci projektu se zaměříme na stanovení výskytu stereotypních BCR a jejich podrobnou molekulární charakterizaci v definovaném souboru CLL. Využijeme nové genomické technologie a cytogenetické metody ke studiu genetických změn v CLL vzorcích a společně s klinickými údaji je budeme analyzovat s ohledem na zastoupení specifických BCR. Pro analýzu problematických případů s vícečetnými přestavbami IG zavedeme „single cell“ multiplexní PCR analýzu pro kompletní stanovení přestaveb těžkých i lehkých řetězců IG v kombinaci s vyšetřením mutací v dalších genech. U biklonálních CLL navrhneme klonálně specifické real-time PCR pro sledování koexistence maligních klonů v čase.
Publications
Total number of publications: 63
2015
-
TP53 mutation analysis in chronic lymphocytic leukemia: comparison of different detection methods
Tumor Biology, year: 2015, volume: 36, edition: 5, DOI
-
Upregulated COBLL1 in chronic lymphocytic leukaemia (CLL) patients with unmutated IGHV identifies a cohort with inferior prognosis
Year: 2015, type: Conference abstract
2014
-
13Q deletion as the most frequently gained abrration during CLL course
Year: 2014, type: Conference abstract
-
Analysis of merkel cell polyomavirus prognostic significance in chronic lymphocytic leukemia
Year: 2014, type: Conference abstract
-
Assessment of TP53 functionality in chronic lymphocytic leukaemia by different assays; an ERIC-wide approach
British journal of haematology, year: 2014, volume: 167, edition: 4, DOI
-
Clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia detected by fluorescence in situ hybridization and conventional cytogenetics after stimulation with CpG oligonucleotides and interleukin-2: A prospective analysis.
Leukemia Research, year: 2014, volume: 38, edition: 2, DOI
-
Deep sequencing for detailed analysis of TP53 mutations clonal evolution in chronic lymphocytic leukemia
Year: 2014, type: Conference abstract
-
Detecting minimal residual disease in patients with chronic lymphocytic leukemia using 8-color flow cytometry protocol in routine hematological practice.
International Journal of Laboratory Hematology, year: 2014, volume: 36, edition: 2, DOI
-
High level of COBLL1, a novel ROR1 binding partner, identifies chronic lymphocytic leukemia (CLL) patients with mutated IghV
Year: 2014, type: Conference abstract
-
Chromosomal translocations and karyotype complexity in chronic lymphocytic leukemia: A systematic reappraisal of classic cytogenetic data
American Journal of Hematology, year: 2014, volume: 89, edition: 3, DOI