Project information
Polymikrobiální biofilm jako příčina chronických močových infekcí a selhávání terapie: kultivační a PCR-DGGE diagnostika, význam a možnosti řešení
- Project Identification
- NT13242
- Project Period
- 4/2012 - 12/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- Ing. Veronika Holá, Ph.D.
- prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Cooperating Organization
-
Centre for Cardiovascular and Transtplantation Surgary
- Responsible person prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Barbora Žaloudíková
- Responsible person MUDr. Petr Kumstát
- Responsible person prof. MUDr. Filip Růžička, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Pavel Trojan
Katétrizace patří k běžným postupům při řadě zákroků, s čímž souvisí fakt že přes 40 % nozokomiálních infekcí jsou právě inf. močového traktu, zejména inf. katétrizovaných pacientů. U polymikrobiálních infekcí ran je známo, že kultivačně lze zachytit pouze část mikrobů a část lze prokázat pouze metodami molekulárními. Mikrobiální diverzita biofilmových společenstev močových stentů a katétrů nebyla dosud uspokojivě prozkoumána. Vhodnou metodou molekulární analýzy se zdá denaturační gradientová gelová elektroforéza (DGGE). Většinou, když byla PCR-DGGE použita, byly zachyceny i bakterie nekultivovatelné, navíc byly prokázány bakterie u daných infekcí dosud neznámé. Cílem projektu je studium druhového složení biofilmových společenstev kultivačně a molekulárními technikami a zhodnocení rozdílů v polymikrobiálních společenstvech ve vztahu k délce zavedení katétru, jeho druhu a dalším faktorům včetně druhů predominujících mikrobiální sukcesi.
Publications
Total number of publications: 14
2017
-
Contribution of PCR Denaturing Gradient Gel Electrophoresis Combined with Mixed Chromatogram Software Separation for Complex Urinary Sample Analysis
Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology, year: 2017, volume: 27, edition: 6, DOI
2016
-
Evaluation of Fluorescent Capillary Electrophoresis for Rapid Identification of Candida Fungal Infections
Journal of Clinical Microbiology, year: 2016, volume: 54, edition: 5, DOI
-
SDS-PAGE and Gel IEF: Tool for Differentiation of Methicillin-Resistant and Methicillin-Sensitive Strains of Staphylococcus aureus
Current Microbiology, year: 2016, volume: 72, edition: 3, DOI
2014
-
Candida parapsilosis Biofilm Identification by Raman Spectroscopy
International Journal of Molecular Sciences, year: 2014, volume: 15, edition: 12, DOI
-
Catheter-related infections caused by Pseudomonas aeruginosa: Virulence factors involved and their relationships
Pathogens and Disease, year: 2014, volume: 72, edition: 2, DOI
-
CIEF separation, UV detection, and quantification of ampholytic antibiotics and bacteria from different matrices
Analytical and Bioanalytical chemistry, year: 2014, volume: 406, edition: 25, DOI
-
Monitoring the influence of antibiotic exposure using Raman spectroscopy
Proceedings of SPIE : BIOMEDICAL VIBRATIONAL SPECTROSCOPY VI: ADVANCES IN RESEARCH AND INDUSTRY, year: 2014
-
Raman tweezers on bacteria: Following the mechanisms of bacteriostatic versus bactericidal action
Proceedings of SPIE : BIOPHOTONICS: PHOTONIC SOLUTIONS FOR BETTER HEALTH CARE IV, year: 2014
-
Separation of Methicillin-Resistant from Methicillin-Susceptible Staphylococcus aureus by Electrophoretic Methods in Fused Silica Capillaries Etched with Supercritical Water
Analytical Chemistry, year: 2014, volume: 86, edition: 19, DOI
2013
-
Effect of biosurfactants on biofilm formation in Proteus bacteria from catheter-associated urinary tract infections
Year: 2013, type: Conference abstract