Project information
Studium proteinu z patogenu zapojených do rozpoznávání hostitelského organismu
- Project Identification
- GA13-25401S
- Project Period
- 2/2013 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Sacharidy jsou v živote nepostradatelné a krome jejich klasické role jako strukturních a energii uchovávajících látek, hrají
klícovou úlohu v mnoha rozpoznávacích signalizacních ci komunikacních procesech. Interakce mezi proteiny a sacharidy se
významne uplatnují pri virových a bakteriálních infekcích, ci v nádorových metastázích. Projekt je primárne zameren na lektiny
a adheziny z bakteriálních patogenu a vláknitých plísní prenášených vzduchem a jejich interakce s lidskými olidosacharidovými
epitopy prítomnými v dýchacích cestách.
Navrhujeme multidisciplinární prístup studia interakcí mezi proteiny a sacharidy, smerující k prevenci adheze patogenu k hostitelským tkáním. Kombinace pokrocilých strukturne funkcních metod umožní provedení racionálního návrhu glykomimetik,
které by mohly inhibovat prichycení patogenu k povrchu bunek a tím pádem být slibnými ligandy predevším pro patogeny
resistentní ke klasické lécbe antibiotiky.
Publications
Total number of publications: 43
2016
-
Different QM/MM Approaches To Elucidate Enzymatic Reactions: Case Study on ppGalNAcT2
Journal of Chemical Theory and Computation, year: 2016, volume: 12, edition: 12, DOI
-
FleA Expression in Aspergillus fumigatus Is Recognized by Fucosylated Structures on Mucins and Macrophages to Prevent Lung Infection
PLoS Pathog, year: 2016, volume: 12, edition: 4, DOI
-
Characterization of lectins from Photorhabdus luminescens to reveal their function in entomopathogenic complex with Heterorhabditis bacteriophora
Year: 2016, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Lectins with beta-propeller fold in opportunistic pathogens
Year: 2016, type: Conference abstract
-
Structural and functional determination of predicted core fucose specific mutants of Ralstonia solanacearum lectin
Year: 2016, type: Conference abstract
-
Structure and function of Photorhabdus asymbiotica lectins: Studies of potential virulence factors from emerging human pathogen
Year: 2016, type: Conference abstract
2015
-
A point mutation led to overturn in sugar-binding specificity of lectin RS-IIL from PA-IIL lectin superfamily
Year: 2015, type: Conference abstract
-
AtomicChargeCalculator: Interactive Web-based calculation of atomic charges in large biomolecular complexes and drug like molecules
Journal of Cheminformatics, year: 2015, volume: 7, edition: 50, DOI
-
Evaluation of Selected Classical Force Fields for Alchemical Binding Free Energy Calculations of Protein-Carbohydrate Complexes
Journal of Chemical Theory and Computation, year: 2015, volume: 11, edition: 7, DOI
-
High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications
Journal of Cheminformatics, year: 2015, volume: 7, edition: DEC, DOI