Project information
Struktura a dynamika biopolymerů
(SDB2014)
- Project Identification
- MUNI/A/0827/2013
- Project Period
- 1/2014 - 12/2014
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Mgr. Lenka Adamová, Ph.D.
- Mgr. Martin Babinský, Ph.D.
- Mgr. Marek Bartošovič, Ph.D.
- Mgr. Pavel Brázda, Ph.D.
- Mgr. Gabriel Demo, Ph.D.
- Mgr. Eva Dubská
- Mgr. Matúš Durec, Ph.D.
- doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
- Mgr. Marek Havrila, Ph.D.
- Mgr. Veronika Horáčková, Ph.D.
- Mgr. Josef Houser, Ph.D.
- Mgr. Eva Chaloupková
- Deepti Jaiswal, Ph.D.
- Olga Jasnovidova, Ph.D., M.Sc.
- Mgr. Tomáš Juřík, Ph.D.
- Tomasz Kabzinski, Ph.D., M.Sc.
- Jitka Kasalová
- Mgr. Jan Komárek, Ph.D.
- Mgr. David Kovář, Ph.D.
- Mgr. Martin Kříž
- Mgr. Zdeněk Kříž, Ph.D.
- Mgr. Vojtěch Kubáň, Ph.D.
- RNDr. Petr Kulhánek, Ph.D.
- prof. RNDr. Radek Marek, Ph.D.
- Mgr. Radek Matuška
- RNDr. Mgr. et Mgr. Arnošt Mládek, Ph.D.
- doc. Mgr. Markéta Munzarová, Dr. rer. nat.
- Mgr. Jan Novotný, Ph.D.
- Ing. Joanna Oniskiewicz, M.Sc.
- Mgr. Olga Otrusinová
- Purbaj Pant, Ph.D.
- Mgr. Gita Paulíková, Ph.D.
- RNDr. Lukáš Pravda, Ph.D.
- prof. RNDr. Petr Skládal, CSc.
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Mgr. Stanislav Standara
- doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.
- Rafal Kazimierz Szabla, Ph.D.
- prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- prof. Mgr. Richard Štefl, Ph.D.
- Ing. Tomáš Trnka, Ph.D.
- prof. RNDr. Robert Vácha, PhD.
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Dagmar Zigáčková, Ph.D.
- prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.
Cílem projektu Struktura a dynamika biopolymerů je propojení informací o 3D strukturách velkých biologicky aktivních makromolekulárních látek (zejména bílkovin, nukleových kyselin a jejich funkčních komplexů) dohromady s informacemi o jejich vlastnostech i biologických rolích, za účelem detailního popisu důležitých fyziologických stejně jako patologických procesů, jichž se tyto makromolekuly účastní na buněčné úrovni. Metodologicky se projekt opírá o řadu experimentů s komplementárním rozsahem prostorového i časového rozlišení zahrnujících metody rentgenové difrakce monokrystalů, nukleární magnetickou rezonanci (NMR), mikroskopii atomových sil (AFM) doplněné o metody poskytující informace o mezimolekulárních interakcích. Experimenty využívané v projektu jsou navrženy za účelem pochopení základních principů fungování molekul v živých organizmech a často se opírají o in-vitro systematické studie za využití celé škály biofyzikálních nástrojů doplněné o teoretické studie postavené na výpočetní chemii, chemo- a bioinformatice. Detailní zájem je věnován dynamickému chování (časovým proměnám) třírozměrných struktur na časové škále pokrývající rozsah od 10E-10 do 10E-2 s, čímž získáme ucelený obraz o dynamice klíčových buněčných komponent. V rámci projektu je taktéž vymezen prostor pro vývoj nových metod strukturní biologie a zpracování získaných dat pro biochemické, biomedicínské a biotechnologické aplikace. Řešení jednotlivých cílů projektů se budou standardně účastnit studenti magisterských a doktorských studijních programů garantovanými Národním centrem pro výzkum biomolekul (zejména Biomolekulární chemie) ale i ostatních oborů, na jejichž vzdělávání se NCBR podílí.