Project information
Molekulární stavba protein-DNA komplexů zapojených v opravě nukleotidových sestřihů
- Project Identification
- GJ15-22380Y (kod CEP: GJ15-22380Y)
- Project Period
- 1/2015 - 12/2017
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Junior projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Současná úroveň studia protein-DNA komplexů, které koordinují odštěpení na 5'konci během procesu NER, kombinuje různé biochemické a strukturní nástroje. Naším cílem je detailní popis rozpoznání DNA křížení, katalytické funkce heterodimeru XPF/ERCC1 a pochopení kritické role XPA při karcinogenním poškození a modulaci aktivity XPF/ERCC1. Abychom mohly tyto jevy zkoumat, zavedeme multidisciplinární postup který se skládá z pokročilých metod NMR spektroskopie v roztoku, strukturní informace z měření rozptylu pod malým úhlem (SAXS) a inovativních postupů molekulového modelování. Tato studie poskytne nový mechanistický vhled do hlavního obranného systému proti UV záření a karcinogenům, velice podstatného pro lidské zdraví. Naše závěry a objevy napomůžou propojit recesivní mutace, funkce a související onemocnění a zároveň najít nové prostředky k modulaci NER funkce pro další terapeutické využití.
Publications
Total number of publications: 4
2018
-
Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays
Journal of Biological Chemistry, year: 2018, volume: 293, edition: 42, DOI
-
Automated NMR resonance assignments and structure determination using a minimal set of 4D spectra
Nature Communications, year: 2018, volume: 9, edition: JAN, DOI
-
Conformational Selection of Dimethylarginine Recognition by the Survival Motor Neuron Tudor Domain
Angewandte Chemie International Edition, year: 2018, volume: 57, edition: 2, DOI
2016
-
A rapid method for detecting protein-nucleic acid interactions by protein induced fluorescence enhancement
Scientific Reports, year: 2016, volume: 6, edition: December, DOI