Go to main content | Go to main menu | Go to search

Project information
Rostlinné transpozony a konformace DNA

Investor logo
Project Identification
GA15-02891S
Project Period
1/2015 - 12/2017
Investor / Pogramme / Project type
Czech Science Foundation
  • Standard Projects
MU Faculty or unit
Faculty of Informatics
Cooperating Organization
The Academy of Sciences of the Czech Republic
  • Responsible person doc. RNDr. Eduard Kejnovský, CSc.

Transpozony jsou významnou součástí rostlinných genomů ovlivňující jejich fungování i evoluci. U některých druhů tvoří až 90% genomu. Transpozony obsahují důležité regulační oblasti, o nichž bylo nedávno zjištěno, že obsahují sekvence schopné tvořit vícevláknové konformace DNA - kvadruplexy a triplexy. V rámci navrhovaného projektu budeme podrobně studovat výskyt kvadruplexů v hlavních rodinách transpozonů (u LTR- a nonLTR retrotranspozonů) u osekvenovaných druhů rostlin. Schopnost vybraných sekvencí tvořit kvadruplexy budeme ověřovat pomocí cirkulárního dichroismu. V kvasinkách a poté i v Arabidopsis thaliana budeme sledovat vliv transpozonových kvadruplexů na expresi reportérového genu a na aktivitu transpozonů. Protože kvadruplexy a triplexy ovlivňují rekombinaci DNA, budeme sledovat jak jejich výskyt v transpozonech souvisí s umístěním transpozonů v genomu, zejména v oblastech se sníženou rekombinací nebo bez rekombinace (například chromosom Y). Naše výsledky přispějí k pochopení úlohy neobvyklých konformací DNA v životním cyklu transpozonů i jejich dopadu na rostlinný genom.

Publications

Total number of publications: 5

2018

2017

2016

2015

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info