Project information
Funkce UPF1 helikázy v procesech odehrávajících se v buněčném jádře
- Project Identification
- GA16-18578S
- Project Period
- 1/2016 - 12/2018
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Nesmyslné mRNA jsou v buňkách degradovány speciálním mechanizmem, kterému se říká “nonsense
mediated RNA decay (NMD)”. Zatímco biochemický mechanizmus NMD byl podrobně studován,
biologické funkce zúčastněných proteinů nejsou plně pochopeny. Tyto proteiny se zřejmě podílí i na
dalších buněčných procesech mimo NMD, ale tyto neortodoxní funkce jsou jenom málo prozkoumány. To
je dáno tím, že inaktivace těchto proteinů je většinou letální. V tomto projektu budeme studovat
neortodoxní funkce UPF1, RNA helikázy nezbytné pro NMD. Podařilo se nám získat žijící mutanty u modelové rostliny Arabidopsis thaliana, které mají UPF1 inaktivní. U těchto rostlin budeme zkoumat, jaký
účinek má ztráta UPF1 na strukturu chromatinu, aktivaci transpozonů, funkci telomer, stability genomu a buněčný cyklus. Také určíme, zda se UPF1 nachází na chromatinu a jaký význam má ATPázová a helikázová aktivita ve výše zmíněných procesech. Díky vysoké homologii rostlinných a lidských UPF1
proteinů se dá předpokládat, že výsledky našeho výzkumu budou aplikovatelné i na jiné organizmy včetně člověka.
Publications
Total number of publications: 4
2020
-
Abiotic stress-mediated modulation of the chromatin landscape in Arabidopsis thaliana
Journal of Experimental Botany, year: 2020, volume: 71, edition: 17, DOI
-
Nonsense-Mediated RNA Decay Factor UPF1 Is Critical for Posttranscriptional and Translational Gene Regulation in Arabidopsis
Plant Cell, year: 2020, volume: 32, edition: 9, DOI
2019
-
artMAP: A user-friendly tool for mapping ethyl methanesulfonate-induced mutations in Arabidopsis
PLANT DIRECT, year: 2019, volume: 3, edition: 6, DOI
2018
-
Functional Characterization of SMG7 Paralogs in Arabidopsis thaliana
Frontiers in Plant Science, year: 2018, volume: 9, edition: NOV, DOI