Project information
Poruchy tvorby protilátek a komplementového systému
- Project Identification
- MUNI/A/0925/2017
- Project Period
- 1/2018 - 12/2018
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Grant Agency of Masaryk University
- Category A
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. Jiří Litzman, CSc.
- Mgr. Kristýna Fiedorová
- prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D.
- MUDr. Roman Hakl, Ph.D.
- MUDr. Eva Hlaváčková, Ph.D.
- Mgr. Pavla Hujová, Ph.D.
- Mgr. Iva Kotásková, Ph.D.
- Mgr. Tatiana Kováčová, Ph.D.
- Mgr. Peter Slanina
- Mgr. Marcela Vlková, Ph.D.
Návrh navazuje na projekty MUNI/A/1183/2015 a MUNI/A/1206/2016. Je zaměřen na studium deficitů v tvorbě protilátek a výzkum dysregulace v komplementovém systému – jmenovitě u deficitu C1-INH – hereditárního angioedému (HAE).
V oblasti HAE budeme pokračovat ve sledování významu a rozsahu aktivace granulocytů v klidovém období i v době ataky (MUDr. R. Hakl). Dále se budeme zabývat sekvenováním intronových oblastí genu SERPING1 (je zodpovědný za HAE) a testováním vlivu detekovaných variant na sestřih pre-mRNA u 4 rodin, u nichž dosavadní analýza neprokázala kauzální mutaci tohoto genu (Mgr. P. Hujová). Budeme též pokračovat v podrobnějším studiu regulačních mechanizmů sestřihu a exprese mRNA genu SERPING1, včetně prací na konfirmaci hypotézy o autoregulaci exprese C1-INH (Mgr. T. Kováčová).
V části věnované protilátkovým imunodeficitům budeme pokračovat ve stanovení střevního mikrobiomu (bakteriální i houbové frakce) u nemocných se závažnou primární agamoglobulinémií - běžným variabilním imunodeficitem (CVID) s využitím stávajících metod fragmentační analýzy (FA) pro houby a sekvenování nové generace (NGS) pro bakterie (Mgr. K. Fiedorová, Mgr. I. Kotásková).
Z hlediska patogeneze se budeme věnovat významu deficitní stimulace B-lymfocytů T-lymfocyty u nemocných s CVID. B-lymfocyty pacientů s CVID budou stimulovány T-dependentními i T-independentními signály. Výsledky budou analyzovány metodou mnohobarevné průtokové cytometrie a ELISA (Mgr. P. Slanina).
MUDr. Hlaváčková bude pokračovat ve sběru klinických a laboratorních údajů o sekundárních poruchách tvorby protilátek, která se vyvíjí po léčbě cílené na ablaci B-lymfocytů, zejména se zaměřením na rekonstituci B-lymfocytárních subpopulací a tvorbu protilátek po proběhlé léčbě.
Budeme také pokračovat také ve studiu využití molekulárních metod pro analýzu polymikrobiálních klinických vzorků. V následujícím roce se chceme zaměřit na metody next-generation sequencing pro analýzu méně diverzních vzorků (např. centrálních venózních katétrů) (Mgr. I. Kotásková, Mgr. K. Fiedorová).
Jako formu výstupů předpokládáme především dokončení dizertační práce MUDr. R. Hakla, publikaci 2-3 článků (s dedikací projektu) v impaktovaných časopisech a prezentace na konferencích.
Publications
Total number of publications: 20
2019
-
Actinotignum schaalii as a part of urinary catheter associated microbiota
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Capability of Fluorescent Capillary Electrophoresis To Distinguish Species of the Candida parapsilosis Complex
Journal of Clinical Microbiology, year: 2019, volume: 57, edition: 5, DOI
-
Fluorescent Capillary Electrophoresis Applied to Distinguish Species of Candida parapsilosis Complex
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Fluorescent Capillary Electrophoresis Is Superior to Culture in Detecting Candida Species from Samples of Urinary Catheters and Ureteral Stents with Mono- or Polyfungal Biofilm Growth
Journal of Clinical Microbiology, year: 2019, volume: 57, edition: 4, DOI
-
Gut microbiome analysis in common variable immunodeficiency (CVID) patients and paired healthy controls sharing the same household
Year: 2019, type: Conference abstract
-
Human native endocarditis caused by Streptococcus canis-a case report
Journal of Pathology, Microbiology and Immunology, APMIS, year: 2019, volume: 127, edition: 1, DOI
-
Molecular Techniques Complement Culture-Based Assessment of Bacteria Composition in Mixed Biofilms of Urinary Tract Catheter-Related Samples
Frontiers in Microbiology, year: 2019, volume: 10, edition: 462, DOI
-
Neutrophils Are Dysregulated in Patients with Hereditary Angioedema Types I and II in a Symptom-Free Period
Mediators of Inflammation, year: 2019, volume: 2019, edition: 9515628, DOI
-
The Impact of DNA Extraction Methods on Stool Bacterial and Fungal Microbiota Community Recovery
Frontiers in Microbiology, year: 2019, volume: 10, edition: 821, DOI
2018
-
Analýza mykobiomu aneb chybami se člověk učí.
Year: 2018, type: Conference abstract