Project information
Genetic determination of bradykinin-mediated angioedema severity in patients with hereditary angioedema
- Project Identification
- NV18-05-00330
- Project Period
- 5/2018 - 12/2022
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Centre for Cardiovascular and Transtplantation Surgary
- Responsible person prof. MUDr. Tomáš Freiberger, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Roman Hakl, Ph.D.
Hereditární angioedém (HAE) je charakterizován rekurentími atakami otoků a je spojen se sníženou hladinou a/nebo funkcí C1 inhibitoru (SERPING1), což vede k lokální nadprodukci bradykininu a následnému rozvoji angioedému. I v rodinách se stejnou mutací v SERPING1 se HAE projevuje s různou závažností. Genetická determinace této různorodosti je dosud neobjasněna. Projekt by měl vysvětlit, které genetické faktory přispívají k této variabilitě. S použitím cílené DNA-seq bude charakterizováno celkem 70 genů souvisejících s funkčností bradykininu u pacientů s různou závažností HAE. Další faktory, které mohou způsobovat rozdílnost fenotypu se týkají regulace genové exprese, což nemusí souviset přímo se změnami sekvencí těchto genů, ale spíše se změnami regulačních faktorů, které ovlivňují expresi jednotlivých genů. Proto budeme pomocí cíleného RNA-seq sledovat expresi vybraných genů (včetně SERPING1) v monocytech/makrofázích vybrané skupiny pacientů. Unikátní kombinace genomických i transkriptomických dat by měla přispět k porozumění mechanismu angioedémů a cílenější medikaci.
Publications
Total number of publications: 10
2023
-
Myeloid lineage cells evince distinct steady-state level of certain gene groups in dependence on hereditary angioedema severity
FRONTIERS IN GENETICS, year: 2023, volume: 14, edition: July 2023, DOI
-
PLAUR splicing pattern in hereditary angioedema patients' monocytes and macrophages
Molecular Biology Reports, year: 2023, volume: 50, edition: 6, DOI
-
Systematic Approach Revealed SERPING1 Splicing-Affecting Variants to be Highly Represented in the Czech National HAE Cohort
Journal of Clinical Immunology, year: 2023, volume: 43, edition: 8, DOI
2022
-
Different patterns of immune system activation in hereditary angioedema based on disease severity
Year: 2022, type: Conference abstract
-
SERPING1 Variants and C1-INH Biological Function: A Close Relationship With C1-INH-HAE
Frontiers in allergy, year: 2022, volume: 3, edition: March 2022, DOI
2021
-
A spectrum of SERPING1 mutations and clinical characterisation of Czech Hereditary Angioedema patients.
Year: 2021, type: Conference abstract
2020
-
Deep Intronic Mutation in SERPING1 Caused Hereditary Angioedema Through Pseudoexon Activation
Journal of Clinical Immunology, year: 2020, volume: 40, edition: 3, DOI
2019
-
Neutrophils Are Dysregulated in Patients with Hereditary Angioedema Types I and II in a Symptom-Free Period
Mediators of Inflammation, year: 2019, volume: 2019, edition: 9515628, DOI
-
SERPING1 exon 3 splicing variants using alternative acceptor splice sites
Molecular Immunology, year: 2019, volume: 107, edition: MAR 2019, DOI
2018
-
Treatment of Hereditary Angioedema Attacks with Icatibant and Recombinant C1 Inhibitor During Pregnancy
Journal of Clinical Immunology, year: 2018, volume: 38, edition: 7, DOI