Project information
Integrative studies of molecular mechanisms of mammalian epitranscriptome
- Project Identification
- LTC18052
- Project Period
- 6/2018 - 9/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Education, Youth and Sports of the CR
- INTER-EXCELLENCE
- INTER-COST
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Cílem projektu je studium mechanismů a funkce chemických modifikacích mRNA pomocí integrativního přístupu využívajícího kombinaci chemických, molekulárně biologických, genetických a výpočetních studií prostřednictvím propojení několika evropských pracovišť s danými expertízami. Projekt je zaměřen na metodický vývoj metod pro detekci a kvantifikaci modifikací RNA, na objasnění mechanismů adenosinových modifikací a prozkoumání potenciální synergie mezi deaminací a metylací adenosinů. Studované téma je úzce v souladu s akcí COST CA16120 zaměřeného na vytvoření evropské sítě výzkumných pracovišť se specializací v Epitranskriptomice, což prostřednictvím vzájemné spolupráce a výměny znalostí zefektivní získávání poznatků v tomto mladém, dynamickém a kompetitivním oboru.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.
Publications
Total number of publications: 8
2022
-
HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs
RNA, year: 2022, volume: 28, edition: 12, DOI
-
The mechanical regulation of RNA binding protein hnRNPC in the failing heart
Science Translational Medicine, year: 2022, volume: 14, edition: 672, DOI
2021
-
ADAR RNA Modifications, the Epitranscriptome and Innate Immunity
Trends in Biochemical Sciences, year: 2021, volume: 46, edition: 9, DOI
-
Interplays of different types of epitranscriptomic mRNA modifications
RNA Biology, year: 2021, volume: 18, edition: S1, DOI
-
The comprehensive interactomes of human adenosine RNA methyltransferases and demethylases reveal distinct functional and regulatory features
Nucleic acids research, year: 2021, volume: 49, edition: 19, DOI
-
The effects of RNA editing in cancer tissue at different stages in carcinogenesis
RNA Biology, year: 2021, volume: 18, edition: 11, DOI
2019
-
ADAR RNA editing in innate immune response phasing, in circadian clocks and in sleep
Biochimica et biophysica acta - Gene regulatory mechanisms, year: 2019, volume: 1862, edition: 3, DOI
-
The role of RNA adenosine demethylases in the control of gene expression
Biochimica et biophysica acta - Gene regulatory mechanisms, year: 2019, volume: 1862, edition: 3, DOI