Project information
Ortogonalizace metabolismu sacharidů v bakteriálním šasi Pseudomonas putida EM42 pro ko-utilizaci cukrů z rostlinné biomasy
- Project Identification
- GJ19-06511Y
- Project Period
- 1/2019 - 12/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Junior projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
- Mgr. Lukáš Chrást
- Mgr. Antonín Kunka, Ph.D.
Sacharidy a aromatické uhlovodíky získané z obnovitelné lignocelulózy (rostlinné biomasy) mohou sloužit jako levné substráty pro biotechnologickou produkci látek s přidanou hodnotou. Dobře charakterizovaných mikroorganismů, které by mohly efektivně katalyzovat tyto přeměny, se však stále nedostává. Pseudomonas putida KT2440 je bezpečná, robustní, původem půdní bakterie, nejdůkladněji prozkoumaná pseudomonáda známá vysokou odolností ke stresům. Tento kmen byl již využit pro produkci cenných látek z glukosy a ligninových arenů. Jeho potenciál pro zužitkování dalších produktů řízeného rozkladu lignocelulózy je však limitován absencí vhodných katabolických drah. V navrhovaném projektu využijeme nejnovější nástroje a postupy metabolického inženýrství a syntetické biologie pro bezprecedentní přestavbu katabolismu sacharidů v kmeni P. putida EM42, což je P. putida KT2440 s redukovaným genomem a lepšími fyziologickými vlastnostmi. Výsledná rekombinantní bakterie bude sloužit jako nová mikrobiální platforma pro paralelní utilizaci hlavních sacharidů z rostlinné biomasy.
Publications
Total number of publications: 12
2022
-
Constructing a mutualistic Pseudomonas putida consortium for utilisation of plant waste derived oligosaccharides
Year: 2022, type: Appeared in Conference without Proceedings
2021
-
An automated DIY framework for experimental evolution of Pseudomonas putida
Microbial Biotechnology, year: 2021, volume: 14, edition: 6, DOI
-
An updated structural model of the A domain of the Pseudomonas putida XylR regulator poses an atypical interplay with aromatic effectors
Environmental Microbiology, year: 2021, volume: 23, edition: 8, DOI
-
Elucidation and rational de-bottlenecking of semi-synthetic metabolism of D-xylose in Pseudomonas putida
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Engineering Pseudomonas putida for co-utilization of cellobiose with glucose
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Engineering Pseudomonas putida whole-cell biocatalysts for biotechnological processing of lignocellulosic substrates
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Engineering the interior and exterior of Pseudomonas putida for biotechnological processing of lignocellulosic (LC) substrates
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Konstrukce jednoduchého syntetického bakteriálního konsorcia s dělbou práce
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Pseudomonas putida consortium for utilisation of oligosaccharides from plant biomass
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
Upgrading Pseudomonas putida by synthetic biology for biotechnological processing of lignocellulosic substrates.
Year: 2021, type: Appeared in Conference without Proceedings