Project information
How hybridisation and allopolyploidisation affect the diversity in three Brassicaceae tribes
- Project Identification
- GA19-06632S
- Project Period
- 1/2019 - 6/2022
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Charles University
- Responsible person prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
Projekt se zabývá vlivem hybridizace a alopolyploidie při vytváření diverzity na příkladu tří tribů z čeledi Brassicaceae. Věnuje se genomickým, fenotypovým a ekologickým důsledkům vnitro- a meziploidního křížení a zhodnocení jeho významu pro rostliny v jejich přirozeném prostředí. Projekt využívá široké spektrum technik: genomických (RADseq, Hyb-seq target enrichment,
mikrosatelitové markery), in situ hybridizace (GISH, FISH, srovnávací malování chromozómů -CCP), měření obsahu DNA (velikosti genomu), multivariační morfometriky, asistovaná hybridizace a modelování ekologických a klimatických nik. Nespornou výhodou řešitelského kolektivu slibující zdárné řešení projektu je detailní znalost zahrnutých rostlinných systémů
včetně jejich evoluční historie, zkušenost s navrhovanými metodami u studovaných rodů i již sebraný materiál pro analýzy DNA. Příbuznost zkoumaných taxonů modelovému druhu Arabidopsis thaliana usnadňuje použití a interpretaci genomických metodik a zároveň zajišťuje
širokou odezvu publikovaných výsledků.
Publications
Total number of publications: 3
2021
-
Allele Sorting as a Novel Approach to Resolving the Origin of Allotetraploids Using Hyb-Seq Data: A Case Study of the Balkan Mountain Endemic Cardamine barbaraeoides
Frontiers in Plant Science, year: 2021, volume: 12, edition: April, DOI
-
Novelty and Convergence in Adaptation to Whole Genome Duplication
Molecular Biology and Evolution, year: 2021, volume: 38, edition: 9, DOI
2020
-
So Closely Related and Yet So Different: Strong Contrasts Between the Evolutionary Histories of Species of the Cardamine pratensis Polyploid Complex in Central Europe
Frontiers in Plant Science, year: 2020, volume: 11, edition: December 2020, DOI