Project information
Chemical modulation of Ku activity and its use in genome editing
- Project Identification
- GA19-21961S
- Project Period
- 3/2019 - 12/2021
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Integrita genomu je řízena několika mechanismy, mezi kterými jsou nejsložitější dráhy zabývající se zlomenými konci DNA. Kvůli své silné vazebné aktivitě na DNA konce je Ku jednou z klíčových molekul zapojených do metabolismu DNA zlomů. Je nezbytná pro opravu DNA pomocí nehomologického koncového spojování, ale je také nezbytná pro integritu telomer.
Díky své důležité funkci při udržování genomu zkoumání Ku otevírá zajímavé možnosti v oblasti biotechnologie a medicíny. Doposud byla funkce Ku modifikována geneticky, protože nejsou k dispozici žádné chemické inhibitory. Zde navrhujeme studovat mechanismus interakce Ku-DNA s důrazem na C-terminální SAP doménu Ku70. Dále chceme provést screening chemických
knihoven k identifikaci sloučenin, které inhibují vazbu Ku na DNA. Identifikované inhibitory budou biochemicky charakterizovány a testovány na jejich biologickou aktivitu in vivo. Nakonec zjistíme, zda tyto sloučeniny ovlivňují účinnost při cílení genů a spektrum mutací indukovaných
CRISPR / Cas9 v rostlinných buňkách.
Publications
Total number of publications: 3
2023
-
The SAP domain of Ku facilitates its efficient loading onto DNA ends
Nucleic Acids Research, year: 2023, volume: 51, edition: 21, DOI
2021
-
A hypomorphic allele of telomerase uncovers the minimal functional length of telomeres in Arabidopsis
Genetics, year: 2021, volume: 219, edition: 2, DOI
-
High-Throughput Protein-Nucleic Acid Interaction Assay Based on Protein-Induced Fluorescence Enhancement
RNA REMODELING PROTEINS, year: 2021, number of pages: 9 s.