Project information
Rekonstrukce syntetických dlouhých sekvencí za použití molekulárního barkódování
- Project Identification
- MUNI/71/04202001/2021
- Project Period
- 2/2021 - 2/2022
- Investor / Pogramme / Project type
-
Masaryk University
- Internal projects of TTO
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
Vyvinuli jsme novou metodu pro začlenění jedinečných molekulárních identifikátorů (unique molecular identifier-UMI) do oligonukleotidů s následnou analýzou. Tuto metodu lze použít pro přípravu RNA/DNA knihoven sekvenování nové generace (NGS). Návrh zavedených UMI umožňuje následnou rekonstrukci dlouhých sekvencí (long-reads) a korekci chyb PCR vedoucí k přesně kvantifikovaným „fázovaným“ genomickým sekvencím. Tato technologie může být použita v různých oblastech, jako je lékařská genomika, de novo genomové sestavení, farmakogenetika, metagenomika (16S RNA sekvenování), molekulární diagnostika, nádorová genomika a imunogenomika atd.
Naším cílem je použít techniku pro úplnou bakteriální rekonstrukci 16S RNA (metagenomické účely). Kromě toho lze tuto metodu dále testovat na molekulární cíle, kde je nezbytné fázování SNP / mutace (farmakogenetické cíle atd.) a nemusí být dosaženo standardními metodami.
Sustainable Development Goals
Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.