Project information
Rekonstrukce syntetických dlouhých sekvencí za použití molekulárního barkódování

Project Identification
MUNI/71/04202001/2021
Project Period
2/2021 - 2/2022
Investor / Pogramme / Project type
Masaryk University
MU Faculty or unit
Central European Institute of Technology

Vyvinuli jsme novou metodu pro začlenění jedinečných molekulárních identifikátorů (unique molecular identifier-UMI) do oligonukleotidů s následnou analýzou. Tuto metodu lze použít pro přípravu RNA/DNA knihoven sekvenování nové generace (NGS). Návrh zavedených UMI umožňuje následnou rekonstrukci dlouhých sekvencí (long-reads) a korekci chyb PCR vedoucí k přesně kvantifikovaným „fázovaným“ genomickým sekvencím. Tato technologie může být použita v různých oblastech, jako je lékařská genomika, de novo genomové sestavení, farmakogenetika, metagenomika (16S RNA sekvenování), molekulární diagnostika, nádorová genomika a imunogenomika atd.
Naším cílem je použít techniku pro úplnou bakteriální rekonstrukci 16S RNA (metagenomické účely). Kromě toho lze tuto metodu dále testovat na molekulární cíle, kde je nezbytné fázování SNP / mutace (farmakogenetické cíle atd.) a nemusí být dosaženo standardními metodami.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.

Sustainable Development Goal No.  3 – Good health and well-being Sustainable Development Goal No.  5 – Gender equality Sustainable Development Goal No.  9 – Industry, innovation and infrastructure Sustainable Development Goal No.  15 – Life on land

You are running an old browser version. We recommend updating your browser to its latest version.

More info