Project information
Deciphering the relationship between homolognous recombination and gene silencing
(Vztah rekombinace a umlčení genů)
- Project Identification
- GA23-05284S
- Project Period
- 1/2023 - 12/2025
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Současná aktivita transkripce a replikace nebo opravy DNA ve stejné genomové oblasti může být významným zdrojem nestability genomu a vyžaduje vhodnou regulaci. Nedávno byla pozorována zajímavá souvislost mezi homologní rekombinací (HR) a umlčením genů, ale odpovědné procesy zůstávají neznámé. V tomto projektu se snažíme tyto procesy objasnit a identifikovat zúčastněné hráče a mechanismy s využitím poltivé kvasinky jako modelového organismu. Použijeme víceúrovňový přístup, který integruje transkripční, chromatinové a molekulární analýzy, abychom ukázali, že umlčování genů je inherentním mechanismem replikační dráhy závislé na rekombinaci. Ukážeme, že umlčení závisí na bariérách replikační vidlice a vyskytuje se převážně během replikace DNA. Také identifikujeme zodpovědné změny chromatinu a proteinové interakce, včetně klíčové role komplexu SMC5/6. Vzhledem k nejasné úloze SMC5/6 a dalších podílejících se faktorů v omezení transkripce virové DNA je hlubší pochopení jejich propojení s umlčováním genů velmi důležité.
Publications
Total number of publications: 2
2024
-
The interplay of homology-directed repair pathways in the repair of zebularine-induced DNA–protein crosslinks in Arabidopsis
Plant Journal, year: 2024, volume: 119, edition: 3, DOI
2023
-
Characterization of the Physcomitrium patens SMC5/6 complex
Year: 2023, type: Appeared in Conference without Proceedings