Project information
Size matters - exploring the mechanism of MP11ir isoform action in auxin signaling
- Project Identification
- GF25-14425L
- Project Period
- 1/2025 - 12/2027
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- LA Grants
- Partner Agency
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
University of Silesia in Katowice
- Responsible person Barbara Wójcikowska, PhD
Cílem projektu je odhalit regulační vztahy mezi transkripčním faktorem kódovaným
MONOPTEROS (MP) a jím řízenými cílovými geny během procesu somatické embryogeneze
(SE) závislé na auxinu u Arabidopsis. PB1 doména MP je nezbytná pro jeho transkripční
represi při nízkých hladinách auxinu. Alternativním sestřihováním vzniká izoforma MP11ir,
jejímž výsledkem je zkrácený protein MP bez domény PB1. Předběžné studie polského a českého týmu identifikovaly MP11ir během procesu SE v Arabidopsis. Tento výzkum zmapuje
mechanismus působení MP11ir a MP během procesu SE vytvořením genetické sítě MP11ir
/MP. Technikou greenCUT&RUN bude sestaven seznam genů pod jejich přímou kontrolou,
filtrovaných pro jejich rozdílnou expresi během embryogenního přechodu bioinformatickou
analýzou. Vybrané kandidátní geny budou funkčně posouzeny. Projekt identifikuje a charakterizuje nové geny s klíčovou úlohou v embryogenních přechodech přímo regulovaných
MP11ir/MP a rozšíří znalosti o úloze izoforem ve vývoji rostlin.