Project information
Unraveling G-Quadruplex and Helicase-derived peptide interaction by spectroscopic and spectrometric methods

Interakce protein-DNA jsou kritické v buněčných procesech a genetických nestabilitách, zejména pokud jde o G-kvadruplexy (G4) a jejich doplňkové sekvence bohaté na C (i-Motif). Helikázy regulují tvorbu těchto struktur a peptidy z motivů helikáz mohou účinně zkoumat atomistické detaily interakcí G4-Helikáz, a dešifrovat vztahy mezi strukturou a aktivitou. Náš projekt bude využívat kombinaci biofyzikálních technik s nízkým a vysokým rozlišením (například NMR, ESI-MS a smFRET) ke zkoumání atomistických detailů těchto interakcí. Budeme také zkoumat náchylnost komplexů G4-peptid k tvorbě oddělených fází kapalina-kapalina a molekulární hnací síly. Naše zjištění objasní základní mechanismy interakcí mezi helikázou a substrátem G4, které jsou nezbytné pro pochopení biologie G4 při jemném ladění genové exprese a potenciálních terapeutických strategií zaměřených na struktury G4.