prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

2003

• Comparative binding energy analysis of haloalkane dehalogenase substrates: modelling of enzyme-substrate complexes by molecular docking and quantum mechanical calculations

  KMUNÍČEK Jan BOHÁČ Michal LUENGO Santos GAGO Federico WADE Rebecca DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Computer-Aided Molecular Design, rok: 2003, ročník: 17, vydání: 5

• Haloalkane dehalogenase LinB from Sphingomonas paucimobilis UT26: X-ray crystallographic studies of dehalogenation of brominated substrates

  STRELTSOV Victor PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří NAGATA Yuji OAKLEY Aaron WILCE Matthew C.J.

  Článek v odborném periodiku

  Biochemistry, rok: 2003, ročník: 42, vydání: 34

• Modification of Activity and Specificity of Haloalkane Dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26 by Engineering of its Entrance Tunnel

  CHALOUPKOVÁ Radka SÝKOROVÁ Jana PROKOP Zbyněk JESENSKÁ Andrea MONINCOVÁ Marta PAVLOVÁ Martina TSUDA Masataka NAGATA Yuji DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Biological Chemistry, rok: 2003, ročník: 278, vydání: 52

• Rational re-design of haloalkane dehalogenases guided by comparative binding energy analysis

  DAMBORSKÝ Jiří KMUNÍČEK Jan JEDLIČKA Tomáš LUENGO Santos GAGO Federico ORTIZ Angel R. WADE Rebecca C.

  Kapitola v knize

  Enzyme Functionality: Design, Engineering and Screening, rok: 2003, počet stran: 18 s.

• Re-construction of mycobacterial dehalogenase Rv2579 by cumulative mutagenesis of haloalkane dehalogenase LinB

  NAGATA Yuji PROKOP Zbyněk MARVANOVÁ Soňa SÝKOROVÁ Jana MONINCOVÁ Marta TSUDA Masataka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Applied and Environmental Microbiology, rok: 2003, ročník: 69, vydání: 4

• Retron reverse transcriptase rrtT is ubiquitous in strains of Salmonella enterica serovar Typhimurium

  MATIASOVIČOVÁ Jitka FALDYNOVÁ Marcela PRAVCOVÁ Martina KARPÍŠKOVÁ Renata KOLÁČKOVÁ Ivana DAMBORSKÝ Jiří RYCHLÍK Ivan

  Článek v odborném periodiku

  FEMS Microbiology Letters, rok: 2003, ročník: 223, vydání: 2

• Validation of Putative Enzymes from Genomic Projects: Confirmation of Dehalogenation ARv2ctivity for Mycobacterial Protein 579

  MONINCOVÁ Marta NAGATA Yuji PROKOP Zbyněk MARVANOVÁ Soňa SÝKOROVÁ Jana TSUDA Masataka DAMBORSKÝ Jiří

  Článek ve sborníku

  Management and Control of (Undesirable) Microorganisms, IBBS/IBRG Meeting Abstracts, rok: 2003

2002

• Biodegradation of 1,2,3-trichloropropane through directed evolution and heterologous expression of a haloalkane dehalogenase gene

  BOSMA Tjibbe DAMBORSKÝ Jiří STUCKI Gerhard JANSSEN Dick

  Článek v odborném periodiku

  Applied and Environmental Microbiology, rok: 2002, ročník: 68, vydání: 7

• Cloning, expression and preliminary characterization of novel haloalkane dehalogenase DhmA from Mycobacterium avium N85

  JESENSKÁ Andrea BARTOŠ Milan CZERNEKOVÁ Vladimíra RYCHLÍK Ivan PAVLÍK Ivo DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Applied and Environmental Microbiology, rok: 2002, ročník: 68, vydání: 8

• Exploring the structure and activity of haloalkane dehalogenase from Sphingomonas paucimobilis UT26: evidence for product and water mediated inhibition

  OAKLEY Aaron PROKOP Zbyněk BOHÁČ Michal KMUNÍČEK Jan JEDLIČKA Tomáš MONINCOVÁ Marta KUTÁ-SMATANOVÁ Ivana NAGATA Yuji DAMBORSKÝ Jiří WILCE Matthew

  Článek v odborném periodiku

  Biochemistry, rok: 2002, ročník: 41, vydání: 15