Ing. RNDr. Martin Marek, Ph.D., MBA

2021

• Species-selective targeting of pathogens revealed by the atypical structure and active site of Trypanosoma cruzi histone deacetylase DAC2

  MAREK Martin RAMOS-MORALES E. PICCHI-CONSTANTE G.F.A. BAYER T. NORSTROM C. HERP D. SALES P.A. GUERRA-SLOMPO E.P. HAUSMANN K. CHAKRABARTI A. SHAIK T.B. MERZ A. TROESCH E. SCHMIDTKUNZ K. GOLDENBERG S. PIERCE R.J. MOURAO MM JUNG M.M. SCHULTZ J. SIPPL W. ZANCHIN N.I.T. ROMIER C.

  Článek v odborném periodiku

  Cell Reports, rok: 2021, ročník: 37, vydání: 12, DOI

• The structure of the mouse ADAT2/ADAT3 complex reveals the molecular basis for mammalian tRNA wobble adenosine-to-inosine deamination

  RAMOS-MORALES Elizabeth BAYAM Efil DEL-POZO-RODRIGUEZ Jordi SALINAS-GIEGE Thalia MAREK Martin TILLY Ramos-Morales, E (Ramos- WOLFF Philippe TROESCH Edouard ENNIFAR Eric DROUARD Laurence GODIN Juliette D. ROMIER Christophe

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2021, ročník: 49, vydání: 11, DOI

2020

• Decoding the intricate network of molecular interactions of a hyperstable engineered biocatalyst

  MARKOVÁ Klára CHMELOVÁ Klaudia MARQUES Sérgio Manuel CARPENTIER Philippe BEDNÁŘ David DAMBORSKÝ Jiří MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Chemical Science, rok: 2020, ročník: 11, vydání: 41, DOI

• Structural and catalytic effects of surface loop-helix transplantation within haloalkane dehalogenase family

  MAREK Martin CHALOUPKOVÁ Radka PRUDNIKOVA Tanyana SATO Yukari REZACOVA Pavlina NAGATA Yuji SMATANOVA KUTA Ivana DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: December 2020, DOI

• Structures of hyperstable ancestral haloalkane dehalogenases show restricted conformational dynamics

  BABKOVÁ Petra DUNAJOVÁ Zuzana CHALOUPKOVÁ Radka DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David MAREK Martin

  Článek v odborném periodiku

  Computational and Structural Biotechnology Journal, rok: 2020, ročník: 18, vydání: 2020, DOI

2019

• Functional switching based on altered enzyme flexibility via InDel mutagenesis of a reconstructed ancestor

  SCHENKMAYEROVA A. PINTO G. MAREK Martin TOUL Martin HERNYCHOVÁ Lenka LIŠKOVÁ Veronika EMOND S. BEDNÁŘ David PROKOP Zbyněk CHALOUPKOVÁ Radka HOLLFELDER F. BORNSCHEUER U.T.

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

• Light-Emitting Dehalogenases: Reconstruction of Multifunctional Biocatalysts

  CHALOUPKOVÁ Radka LIŠKOVÁ Veronika TOUL Martin MARKOVÁ Klára ŠEBESTOVÁ Eva HERNYCHOVÁ Lenka MAREK Martin RANGEL PAMPLONA PIZARRO PINTO José Gaspar PLUSKAL Daniel WATERMAN Jitka PROKOP Zbyněk DAMBORSKÝ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  ACS Catalysis, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 6, DOI

• One-Atom Substitution Enables Direct and Continuous Monitoring of Histone Deacylase Activity

  ZESSIN M. KUTIL Z. MELESHIN M. NOVAKOVA Z. GHAZY E. KALBAS D. MAREK Martin ROMIER C. SIPPL W. BARINKA C. SCHUTKOWSKI M.

  Článek v odborném periodiku

  Biochemistry, rok: 2019, ročník: 58, vydání: 48, DOI

2018

• A Novel Class of Schistosoma mansoni Histone Deacetylase 8 (HDAC8) Inhibitors Identified by Structure-Based Virtual Screening and In Vitro Testing

  SIMOBEN Conrad V. ROBAA Dina CHAKRABARTI Alokta SCHMIDTKUNZ Karin MAREK Martin LANCELOT Julien KANNAN Srinivasaraghavan MELESINA Jelena SHAIK Tajith B. PIERCE Raymond J. ROMIER Christophe JUNG Manfred SIPPL Wolfgang

  Článek v odborném periodiku

  Molecules, rok: 2018, ročník: 23, vydání: 3, DOI

• Characterization of Histone Deacetylase 8 (HDAC8) Selective Inhibition Reveals Specific Active Site Structural and Functional Determinants

  MAREK Martin SHAIK Tajith B. HEIMBURG Tino CHAKRABARTI Alokta LANCELOT Julien RAMOS-MORALES Elizabeth DA VEIGA Cyrielle KALININ Dmitrii MELESINA Jelena ROBAA Dina SCHMIDTKUNZ Karin SUZUKI Takayoshi HOLL Ralph ENNIFAR Eric PIERCE Raymond J. JUNG Manfred SIPPL Wolfgang ROMIER Christophe

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Medicinal Chemistry, rok: 2018, ročník: 61, vydání: 22, DOI