doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.

2019

• Nested plant LTR retrotransposons target specific regions of other elements, while all LTR retrotransposons often target palindromes and nucleosome-occupied regions: in silico study

  JEDLIČKA Pavel LEXA Matej VANÁT Ivan KEJNOVSKÝ Eduard HOBZA Roman

  Článek v odborném periodiku

  Mobile DNA, rok: 2019, ročník: 10, vydání: 1, DOI

• The Impact of DNA Extraction Methods on Stool Bacterial and Fungal Microbiota Community Recovery

  FIEDOROVÁ Kristýna RADVANSKÝ Matěj NĚMCOVÁ Eva GROMBIŘÍKOVÁ Hana BOSÁK Juraj ČERNOCHOVÁ Michaela LEXA Matej ŠMAJS David FREIBERGER Tomáš

  Článek v odborném periodiku

  Frontiers in Microbiology, rok: 2019, ročník: 10, vydání: 821, DOI

2018

• Artificial fungal community (fMOCK) as a control of sequencing process in mycobiome research.

  FIEDOROVÁ Kristýna RADVANSKÝ Matěj GROMBIŘÍKOVÁ Hana NĚMCOVÁ Eva BOSÁK Juraj LEXA Matej ŠMAJS David FREIBERGER Tomáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• Dynamics of human gut microbiome in healthy volunteers from the Czech Republic

  FIEDOROVÁ Kristýna RADVANSKÝ Matěj VANĚRKOVÁ Martina GROMBIŘÍKOVÁ Hana LEXA Matej FREIBERGER Tomáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• Gut microbiome analysis in common variable immunodeficiency (CVID) patients.

  FIEDOROVÁ Kristýna RADVANSKÝ Matěj PAVLÍNA Králíčková MICHAELA Černochová NĚMCOVÁ Eva GROMBIŘÍKOVÁ Hana BOSÁK Juraj LEXA Matej ŠMAJS David LITZMAN Jiří FREIBERGER Tomáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• Quadruplex DNA in long terminal repeats in maize LTR retrotransposons inhibits the expression of a reporter gene in yeast

  TOKAN Viktor PUTEROVÁ Janka LEXA Matej KEJNOVSKÝ Eduard

  Článek v odborném periodiku

  BMC Genomics, rok: 2018, ročník: 19, vydání: 06 03 2018, DOI

• TE-nester: a recursive software tool for structure-based discovery of nested transposable elements

  LEXA Matej LAPÁR Radovan JEDLIČKA Pavel VANÁT Ivan ČERVEŇANSKÝ Michal KEJNOVSKÝ Eduard

  Článek ve sborníku

  Proceedings 2018 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM), rok: 2018

2017

• Gastrointestinal microbiome in patients with primary immune deficiencies

  FIEDOROVÁ Kristýna BOSÁK Juraj ZWINSOVÁ Barbora LEXA Matej LITZMAN Jiří FREIBERGER Tomáš ŠMAJS David

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• pqsfinder: an exhaustive and imperfection-tolerant search tool for potential quadruplex-forming sequences in R

  HON Jiří MARTÍNEK Tomáš ZENDULKA Jaroslav LEXA Matej

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2017, ročník: 33, vydání: 21, DOI

• pqsfinder: identification of potential quadruplex forming sequences

  HON Jiří LEXA Matej MARTÍNEK Tomáš ZENDULKA Jaroslav

  Software

  Rok: 2017