RNDr. Tomáš Raček, Ph.D.

2025

• GOLEM: A tool for visualizing the distribution of Gene regulatOry eLEMents within the plant promoters with a focus on male gametophyte

  NEVOSÁD Lukáš KLODOVÁ Božena RUDOLF Jiří RAČEK Tomáš PŘEROVSKÁ Tereza KUSOVÁ Alžbeta SVOBODOVÁ Radka HONYS David PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ Petra

  Článek v odborném periodiku

  Plant Journal, rok: 2025, ročník: 121, vydání: 5, DOI

2024

• Analysis and Visualization of Protein Channels, Tunnels, and Pores with MOLEonline and ChannelsDB 2.0

  ŠPAČKOVÁ Anna BAZGIER Václav RAČEK Tomáš SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel

  Kapitola v knize

  Protein Bioinformatics, vydání: Vyd. 1, rok: 2024, počet stran: 15 s.

• Data Management of Biological Imaging Data

  SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2024, druh: Další prezentace na konferencích

• ChannelsDB 2.0: a comprehensive database of protein tunnels and pores in AlphaFold era

  ŠPAČKOVÁ Anna VÁVRA Ondřej RAČEK Tomáš BAZGIER Václav SEHNAL David DAMBORSKÝ Jiří SVOBODOVÁ Radka BEDNÁŘ David BERKA Karel

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: D1, DOI

• RBP-Tar – a searchable database for experimental RBP binding sites

  GREŠOVÁ Katarína RAČEK Tomáš MARTINEK Vlastimil ČECHÁK David SVOBODOVÁ Radka ALEXIOU Panagiotis

  Článek v odborném periodiku

  F1000Research, rok: 2024, DOI

• Scientific Dataset Management System for the Research Institute Based on Onedata

  SVOBODA Tomáš ROŠINEC Adrián RAČEK Tomáš HANDL Josef KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

2023

• An Evaluation of EDAM Coverage in the Tools Ecosystem and Prototype Integration of Galaxy and Workflowhub Systems.

  LAMOTHE Lucie JENSEN Jennifer R B IENASESCU Hans GUSTAFSSON Ove J R GAIGNARD Alban REPCHEVSKY Dmitry SVOBODOVÁ Radka RAČEK Tomáš ROŠINEC Adrián ANTOL Matej MÉNAGER Hervé

  Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

  Rok: 2023, druh: Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný)

• Enhancing Data Accessibility: Strategies and Tools for Effective Metadata Management

  ROŠINEC Adrián SVOBODA Tomáš RAČEK Tomáš KŘENEK Aleš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích

• ChannelsDB 2.0: A Comprehensive Database of Protein Tunnels and Pores in AlphaFold Era

  ŠPAČKOVÁ Anna VÁVRA Ondřej RAČEK Tomáš BAZGIER Václav SEHNAL David DAMBORSKÝ Jiří SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Management of life-science data and their metadata

  RAČEK Tomáš SVOBODA Tomáš SVOBODOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2023, druh: Další prezentace na konferencích