prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

2020

• Choice of Force Field for Proteins Containing Structured and Intrinsically Disordered Regions

  ZAPLETAL Vojtěch MLÁDEK Arnošt BENDOVÁ Kateřina LOUŠA Petr NOMILNER Erik JASEŇÁKOVÁ Zuzana KUBÁŇ Vojtěch MAKOVICKÁ Markéta LANÍKOVÁ Alice ŽÍDEK Lukáš HRITZ Jozef

  Článek v odborném periodiku

  Biophysical Journal, rok: 2020, ročník: 118, vydání: 7, DOI

• Structural Basis of Ca2+-Dependent Self-Processing Activity of Repeat-in-Toxin Proteins

  KUBÁŇ Vojtěch MACEK P. HRITZ Jozef NECHVATALOVA K. NEDBALCOVA K. FALDYNA M. ŠEBO Peter ŽÍDEK Lukáš BUMBA L.

  Článek v odborném periodiku

  MBIO, rok: 2020, ročník: 11, vydání: 2, DOI

2019

• Quantitative Conformational Analysis of Functionally Important Electrostatic Interactions in the Intrinsically Disordered Region of Delta Subunit of Bacterial RNA Polymerase

  KUBÁŇ Vojtěch SRB Pavel ŠTÉGNEROVÁ Hana PADRTA Petr ZACHRDLA Milan JASEŇÁKOVÁ Zuzana SANDEROVA H. VITOVSKA D. KRASNY L. KOVAL T. DOHNALEK J. ZIEMSKA-LEGIECKA J. GRYNBERG M. JARNOT P. GRUCA A. JENSEN M.R. BLACKLEDGE M. ŽÍDEK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Journal of the American Chemical Society, rok: 2019, ročník: 141, vydání: 42, DOI

• Structure and Functions of Microtubule Associated Proteins Tau and MAP2c: Similarities and Differences

  MELKOVÁ Kateřina ZAPLETAL Vojtěch NARASIMHAN Subhash JANSEN Séverine HRITZ Jozef SKRABANA R. ZWECKSTETTER M. RINGKJOBING JENSEN M. BLACKLEDGE M. ŽÍDEK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Biomolecules, rok: 2019, ročník: 9, vydání: 3, DOI

2018

• Conformation and dynamics of intrinsically disordered microtubule associated protein 2c

  ZAPLETAL Vojtěch MELKOVÁ Kateřina JANSEN Séverine NOMILNER Erik JENSEN M.R. BLACKLEDGE M. ŽÍDEK Lukáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• Functionally specific binding regions of microtubule-associated protein 2c exhibit distinct conformations and dynamics

  MELKOVÁ Kateřina ZAPLETAL Vojtěch JANSEN Séverine NOMILNER Erik ZACHRDLA Milan HRITZ Jozef NOVÁČEK Jiří ZWECKSTETTER M. JENSEN M.R. BLACKLEDGE M. ŽÍDEK Lukáš

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Biological Chemistry, rok: 2018, ročník: 293, vydání: 34, DOI

• Nuclear Magnetic Resonance

  ZACHRDLA Milan JASEŇÁKOVÁ Zuzana ŽÍDEK Lukáš

  Kapitola v knize

  Plant Structural Biology: Hormonal Regulations, vydání: Vyd. 1, rok: 2018, počet stran: 25 s.

• Protein environment affects the water-tryptophan binding mode. MD, QM/MM, and NMR studies of engrailed homeodomain mutants

  ŠPAČKOVÁ Naděžda TROŠANOVÁ Zuzana SEBESTA F. JANSEN Séverine BURDA J.V. SRB Pavel ZACHRDLA Milan ŽÍDEK Lukáš KOZELKA Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Physical Chemistry Chemical Physics, rok: 2018, ročník: 20, vydání: 18, DOI

• Role of SH3b binding domain in a natural deletion mutant of Kayvirus endolysin LysF1 with a broad range of lytic activity

  BENEŠÍK Martin NOVÁČEK Jiří JANDA Lubomír DOPITOVÁ Radka PERNISOVÁ Markéta MELKOVÁ Kateřina TISAKOVA Lenka DOŠKAŘ Jiří ŽÍDEK Lukáš HEJÁTKO Jan PANTŮČEK Roman

  Článek v odborném periodiku

  Virus Genes, rok: 2018, ročník: 54, vydání: 1, DOI

2017

• Computational characterization of hybrid proteins containing ordered and intrinsically disordered regions

  ZAPLETAL Vojtěch MLÁDEK Arnošt HRITZ Jozef ŽÍDEK Lukáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty