doc. RNDr. Radka Svobodová, Ph.D.

2015

• High-quality and universal empirical atomic charges for chemoinformatics applications

  GEIDL Stanislav BOUCHAL Tomáš RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka HEJRET Václav KŘENEK Aleš ABAGYAN Ruben KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2015, ročník: 7, vydání: DEC, DOI

• How Does the Methodology of 3D Structure Preparation Influence the Quality of pK(a) Prediction?

  GEIDL Stanislav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BENDOVÁ Veronika PETRUSEK Lukáš IONESCU Crina-Maria JURKA Zdeněk ABAGYAN Ruben A. KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2015, ročník: 55, vydání: 6, DOI

• MOLE 2.5: Improved Tool for Analysis of Ligand-Accessible Channels

  PRAVDA Lukáš BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

• MotiveQuery: Web application for fast detection of biomacromolecular fragments in the entire Protein Data Bank

  SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PRAVDA Lukáš SEHNAL David IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

• PatternQuery: web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank

  SEHNAL David PRAVDA Lukáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: W1, DOI

• PatternQuery: Web application for fast detection of biomacromolecular structural patterns in the entire Protein Data Bank

  PRAVDA Lukáš SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

• ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

  SEHNAL David SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PRAVDA Lukáš IONESCU Crina-Maria GEIDL Stanislav HORSKÝ Vladimír JAISWAL Deepti WIMMEROVÁ Michaela KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2015, ročník: 43, vydání: D1, DOI

• ValidatorDB: database of up-to-date validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank

  SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David PRAVDA Lukáš IONESCU Crina-Maria KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

• WebChemistry: a platform for the detection, validation, comparison, and characterization of structural patterns in biomacromolecules

  SEHNAL David PRAVDA Lukáš IONESCU Crina-Maria SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

2014

• Anatomy of enzymatic channels and algorithm for its detection

  PRAVDA Lukáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David IONESCU Crina-Maria BERKA Karel OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2014, druh: Další prezentace na konferencích