Ing. Jana Hozzová, Ph.D.

2020

• Exploring Protein Folding Space with Neural Network Guided Simulations

  KŘENEK Aleš HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav TRAPL Dalibor SPIWOK Vojtěch

  Článek ve sborníku

  MODELLING AND SIMULATION 2020, rok: 2020

2019

• Exploiting historical data: pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps

  OĽHA Jaroslav HOZZOVÁ Jana FOUSEK Jan FILIPOVIČ Jiří

  Článek ve sborníku

  Lecture Notes in Computer Science, rok: 2019

2018

• Acceleration of Mean Square Distance Calculations with Floating Close Structure in Metadynamics Simulations

  PAZÚRIKOVÁ Jana OĽHA Jaroslav KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Výzkumná zpráva

  Rok: 2018

• Kernel Tuning Toolkit

  PETROVIČ Filip FILIPOVIČ Jiří STŘELÁK David PAZÚRIKOVÁ Jana

  Software

  Rok: 2018

2017

• Reducing the number of mean-square deviation calculations with floating close structure in metadynamics

  PAZÚRIKOVÁ Jana KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch ŠIMKOVÁ Mária

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Physics, rok: 2017, ročník: 146, vydání: 11, DOI

2016

• Accelerated RMSD Calculation for Molecular Metadynamics

  FILIPOVIČ Jiří PAZÚRIKOVÁ Jana KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek ve sborníku

  Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference, rok: 2016

• Direct SAXS Curve Fitting with an Ensable of Conformations

  KŘENEK Aleš RAČEK Tomáš PAZÚRIKOVÁ Jana

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2016, druh: Další prezentace na konferencích

• Guided Optimization Method for Fast and Accurate Atomic Charges Computation

  PAZÚRIKOVÁ Jana KŘENEK Aleš MATYSKA Luděk

  Článek ve sborníku

  Proceedings of the 2016 European Simulation and Modelling Conference, rok: 2016

• NEEMP – nástroj pro parametrizaci EEM

  RAČEK Tomáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KŘENEK Aleš PAZÚRIKOVÁ Jana GEIDL Stanislav KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty

• NEEMP: software for validation, accurate calculation and fast parameterization of EEM charges

  RAČEK Tomáš PAZÚRIKOVÁ Jana SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka GEIDL Stanislav KŘENEK Aleš FALGINELLA Francesco Luca HORSKÝ Vladimír HEJRET Václav KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Cheminformatics, rok: 2016, ročník: 8, vydání: October, DOI