Ing. Jana Hozzová, Ph.D.

2022

• Improving ligand transport trajectory within flexible receptor in CaverDock

  NĚMCOVÁ Petra HOZZOVÁ Jana FILIPOVIČ Jiří

  Článek ve sborníku

  SAC '22: Proceedings of the 37th ACM/SIGAPP Symposium on Applied Computing, rok: 2022

• Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction

  TRAPL Dalibor KRUPIČKA MArtin VIŠŇOVSKÝ Vladimír HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2022, ročník: 62, vydání: 3, DOI

• Using hardware performance counters to speed up autotuning convergence on GPUs

  FILIPOVIČ Jiří HOZZOVÁ Jana NEZARAT Amin OĽHA Jaroslav PETROVIČ Filip

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Parallel and Distributed Computing, rok: 2022, ročník: 160, vydání: February, DOI

2021

• 4D-GRAPHS

  BRÁZDIL Tomáš PORTEŠ David FILIPOVIČ Jiří HOZZOVÁ Jana EVANGELIDIS Thomas TRIPSIANES Konstantinos

  Software

  Rok: 2021

• Complex simulation workflows in containerized high-performance environment

  VIŠŇOVSKÝ Vladimír SPIŠAKOVÁ Viktória HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav TRAPL Dalibor SPIWOK Vojtěch HEJTMÁNEK Lukáš KŘENEK Aleš

  Článek ve sborníku

  Proc. ESM 2021, rok: 2021

• Kernel Tuning Toolkit 2.0

  PETROVIČ Filip FILIPOVIČ Jiří STŘELÁK David HOZZOVÁ Jana TREMBECKÝ Richard

  Software

  Rok: 2021

• Searching CUDA code autotuning spaces with hardware performance counters: data from benchmarks running on various GPU architectures

  HOZZOVÁ Jana FILIPOVIČ Jiří NEZARAT Amin OĽHA Jaroslav PETROVIČ Filip

  Článek v odborném periodiku

  Data in Brief, rok: 2021, ročník: 39, vydání: December, DOI

• Simulation of Ligand Transport in Receptors Using CaverDock

  HOZZOVÁ Jana VÁVRA Ondřej BEDNÁŘ David FILIPOVIČ Jiří

  Kapitola v knize

  Protein-Ligand Interactions and Drug Design, rok: 2021, počet stran: 20 s.

2020

• A benchmark set of highly-efficient CUDA and OpenCL kernels and its dynamic autotuning with Kernel Tuning Toolkit

  PETROVIČ Filip STŘELÁK David HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav TREMBECKÝ Richard BENKNER Siegfried FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Future Generation Computer Systems, rok: 2020, ročník: 108, vydání: July, DOI

• Exploiting historical data: Pruning autotuning spaces and estimating the number of tuning steps

  OĽHA Jaroslav HOZZOVÁ Jana FOUSEK Jan FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  CONCURRENCY AND COMPUTATION-PRACTICE & EXPERIENCE, rok: 2020, ročník: 32, vydání: 21, DOI