doc. RNDr. Karel Berka, Ph.D.

2017

• Cytochrome P450 structure anatomy – recognition and analysis of secondary structure elements

  MIDLIK Adam SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka NAVRÁTILOVÁ Veronika BERKA Karel KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

• LiteMol suite: interactive web-based visualization of large-scale macromolecular structure data

  SEHNAL David DESHPANDE Mandar SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka MIR Saqib BERKA Karel MIDLIK Adam PRAVDA Lukáš VELANKAR Sameer KOČA Jaroslav

  Článek v odborném periodiku

  Nature Methods, rok: 2017, ročník: 14, vydání: 12, DOI

• Mapping and 2D visualization of secondary structure elements in cytochromes

  HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka BERKA Karel

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2017, druh: Konferenční abstrakty

2016

• Automatická anotácia sekundárnych štruktúr v cytochrómoch P450 a hodnotenie ich štruktúrnej podobnosti

  MIDLIK Adam BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2016, druh: Konferenční abstrakty

• Structural Bioinformatics Tools for Drug Design: Extraction of Biologically Relevant Information from Structural Databases

  KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka PRAVDA Lukáš BERKA Karel GEIDL Stanislav SEHNAL David OTYEPKA Michal

  Odborná kniha

  Rok: 2016, vydání: Vyd. 1., počet stran: 144 s.

2015

• Anatomy of protein channels

  PRAVDA Lukáš BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David IONESCU Crina-Maria OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2015, druh: Konferenční abstrakty

• MOLE 2.5: Improved Tool for Analysis of Ligand-Accessible Channels

  PRAVDA Lukáš BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2015, druh: Další prezentace na konferencích

2014

• Anatomy of enzymatic channels and algorithm for its detection

  PRAVDA Lukáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David IONESCU Crina-Maria BERKA Karel OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2014, druh: Další prezentace na konferencích

• Anatomy of Enzyme Channels

  PRAVDA Lukáš BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David BANÁŠ Pavel ROMAN A Laskowski KOČA Jaroslav OTYEPKA Michal

  Článek v odborném periodiku

  BMC Bioinformatics, rok: 2014, ročník: 15, vydání: november, DOI

• MOLE: Pokročilý nástroj pro vyhledávání a charakterizaci tunelů

  PRAVDA Lukáš SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka SEHNAL David IONESCU Crina-Maria BERKA Karel OTYEPKA Michal KOČA Jaroslav

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2014, druh: Další prezentace na konferencích