Strukturní biologie/biochemie

Rychlý rozvoj oborů zaměřených na určování struktur biologicky významných makromolekul vyžaduje doplňování znalostí pracovníků aktivních v oboru. Multidisciplinární charakter práce v tomto odvětví vyžaduje rozšiřování kvalifikace za rámec studovaného oboru (upskilling): technicky vzdělaní pracovníci a studenti technických oborů potřebují doplnění biologického vzdělání, biochemici a molekulární biologové potřebují získat technické poznatky. Odborné zázemí a zkušenosti se současnou výukou zajišťovanou naším ústavem vytvářejí vhodné podmínky pro rozšíření aktivit na upskilling v rámci celoživotního vzdělávání. Kurz je přednášen odborníky v oboru přímo pracujícími, kteří mají zároveň dlouholetou pedagogickou praxi.

Realizace kurzu byla podpořena z Národního plánu obnovy v rámci projektu MUNI 3.2.1, registrační číslo NPO_MUNI_MSMT-16606/2022

Rozšíření kurzu Strukturní biochemie je zaměřeno: 1) na studenty a absolventy technických oborů, kteří si potřebují v rámci multidisciplinarity své profese doplnit znalosti o biomakromolekulách (např. pracovník ve vývoji el. mikroskopie) 2) na studenty/absolventy biochemie a biologických oborů, kteří si v rámci rozšiřování kvalifikace potřebují rozšířit znalosti v oboru struktury biomakromolekul a metody jejich zkoumání a 3) na jakékoli jiné zájemce o tuto oblast vědy, například z řad středoškolských učitelů

Termíny kurzu

Nejbližší termín konání kurzu zatím není stanoven.

Vše o studiu

Co se naučíte

Semestrální kurz je rozdělen do pěti tematických bloků:

Struktura biomolekul

Blok čtyř dvouhodinových přednášek popisující základní principy stavby molekul proteinů, nukleových kyselin, oligo- a polysacharidů. Vysvětlení pojmů vnitřní souřadnice, primární, sekundární a terciární struktura. Možnost účasti na praktickém cvičení s modely probíraných molekul.

 

Příprava a charakterizace vzorků biomolekul

Blok dvou dvouhodinových přednášek. Seznámení s metodami přípravy vzorků biomolekul (zejména rekombinantních proteinů), určování sekvence proteinů a nukleových proteinů (hmotnostní spektrometrie, Sangerova metoda), určení zastoupení sekundárních struktur (cirkulární dichroismus, infračervená spektroskopie), určení tvaru molekuly maloúhlovým rozptylem rentgenových paprsků (SAXS). Možnost účasti na praktickém cvičení s vyhodnocováním dat.

 

Výpočetní metody a bioinformatika

Dvě dvouhodinové přednášky. Seznámení s počítačovými simulacemi biomolekul (zejména molekulová dynamika). Analýza sekvenčních a strukturních dat z databází (porovnávání a vyhledávání sekvencí), predikce struktury pomocí umělé inteligence.

 

Rentgenová krystalografie a elektronová mikroskopie

Blok dvou dvouhodinových přednášek. Seznámení se zásadními metodami strukturní analýzy s atomovým rozlišením využívajícími difrakci. Popis principů metod, přípravy vzorků, postupu řešení a validace struktur. Možnost účasti na praktickém cvičení s demonstrací principů.

 

Nukleární magnetická rezonance

Blok dvou dvouhodinových přednášek. Seznámení se strukturní analýzou v roztoku, založenou na magnetické rezonanci a poskytující atomové rozlišení. Popis principu metody a aplikace na vzorky proteinů a nukleových kyselin. Možnost účasti na praktickém cvičení s vyhodnocováním dat.

Uplatnění znalostí

Výstupy z učení jsou zaměřené na získání odborných dovedností a znalostí v jednotlivých oblastech strukturní biochemie a na zvýšení způsobilosti v aplikaci strukturních dat. Základní principy jsou vysvětleny v interaktivních přednáškách doplněných prezentací modelových příkladů a otevřených diskusi. Všechny přednášky jsou shrnuty a rozšířeny o další příklady v elektronické učebnici, poskytované studentům zdarma. Na přednášky navazuje praktické cvičení.

Absolvent kurzu získá multidisciplinární vhled do probírané problematiky. Technicky zaměřený pracovník ve vývoji přístrojů (např. el. mikroskopie, el. spektroskopie) rozšíří své znalosti o zkoumaných molekulách, což výrazně zlepší možnosti jeho uplatnění na trhu práce (např. aplikační technik, manažerské pozice vyžadující znalost techniky i aplikací). Odborník s biologickým nebo

biochemickým vzděláním získá znalosti o strukturních metodách, které zvýší jeho uplatnitelnost na trhu práce do oblastí tuto znalost vyžadující (např. vývoj léčiv, proteinové inženýrství).

Jak se přihlásit

Podmínky pro přijetí

Základní podmínkou pro přijetí je ukončené středoškolské vzdělání a zájem o probíranou problematiku. Registrace probíhá přes webovou stránku kurzu a prostřednictvím IS MUNI.

Průběh studia, lektoři

Podmínky pro ukončení

Podmínkou pro úspěšné absolvování kurzu je osobní účast na většině přednášek, která je evidována formou prezenčních listin.

Lektoři

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

Mgr. Dávid Tužinčin

Informace o kurzu

Zajišťuje Přírodovědecká fakulta
Hodinová dotace 48
Délka vzdělávání v týdnech 12

Váháte?
Máte otázku?

Zajímá vás obsah a podmínky studia kurzu Strukturní biologie/biochemie? Zeptejte se nás:

prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D.

telefon: 549 49 8393
e‑mail:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info