Informace o projektu
Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
- Kód projektu
- MSM0021622413
- Období řešení
- 1/2005 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Výzkumné záměry
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- prof. RNDr. Jaroslav Koča, DrSc.
- Další fakulta/pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- Klíčová slova
- proteiny, vztah struktury a funkce proteinů, komplexy proteinů, proteom, metabolom
Návrh bezprostředně navazuje na předchozí výzkumný záměr "Strukturně funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu", řešený v letech 1998-2004, a zčásti i na projekt "Laboratoř struktury a dynamiky biomolekul" v rámci programu "250" (1996-2000). Klíčovou součástí tohoto výzkumného záměru byla identifikace a charakterizace vybraných bakteriálních proteinů a nízkomolekulárních látek účastnících se metabolismu bakterií a hub. Nově navrhovaný záměr by měl jednak zahrnout i další proteiny z jiných typů organismů, např. živočišné proteiny vážící feromony, ale hlavním přínosem bude rozšíření předmětu zájmu na interakce proteinů s okolím. Řečeno jinak, hlavní inovací bude to, že předmětem zájmu budou komplexy proteinů. Při studiu funkce a regulace enzymů se zaměříme i na rozvoj metod monitorování jejich aktivity za podmínek in vivo analýzou intracelulárních metabolitů. Zapojení odborníků z oblasti instrumentální analytické chemie a experimentální organické chemie a fotochemie umožní neomezovat se na, z pohledu řady metod, „uživatelský přístup“, ale vyvíjet vlastní aktivity k dalšímu rozvoji a implementaci těchto technik v proteomice a metabolomice. Nový záměr bude moci stavět na instrumentální základně, kterou se v minulém období podařilo výrazně posílit. Např. v letech 2001-2002 bylo sdružením prostředků z fondu SZNN MŠMT, minulého výzkumného záměru a grantu GAČR vybudováno moderní pracoviště pro analýzu proteomu, zahrnující dvoudimenzionální elektroforézu, denzitometrii s analýzou obrazu a hmotnostní spektrometrii proteinů. Vynikající je také strukturní a počítačové zázemí projektu, a to jak z hlediska instrumentálního tak z hlediska lidských zdrojů. Výrazně byla inovována molekulárně biologická infrastruktura záměru (např. zřízena nová laboratoř pro studium interakce rostlin s patogeny). Těmito změnami se otevírá pole využití moderních metod genomiky, proteomiky a metabolomiky při akcentaci biochemického a strukturního pohledu na řešenou problematiku. Celková hodnota investičních zařízení, která budou v rámci řešení výzkumného záměru používána, přesahuje částku 100 mil. Kč. Investiční úsilí podávaného výzkumného záměru bude sledovat základní myšlenku udržet alespoň rámcově krok v oblasti instrumentace používané v té části současné moderní biochemie a strukturní biologie, která se zabývá proteiny. K základním cílům výzkumného záměru v oblasti personální bude udržet na fakultě mladé kvalitní výzkumné pracovníky, kteří buď byli fakultou vychováni či na fakultu přišli v rámci vládních programů na posílení výzkumu na vysokých školách či výzkumných center.
Publikace
Počet publikací: 836
2005
-
No Proton - No problem. Non-protonated Nuclei in NMR Studies of Nucleic Acids
XXI International Conference on MagneticResonance in Biological Systems-Abstracts, rok: 2005
-
Piezoelectric affinity sensors for cocaine and cholinesterase inhibitors
Talanta, rok: 2005, ročník: 65, vydání: 2
-
Piezoelectric immunosensor for Francisella tularensis detection using immunoglobulin M in a limiting dilution
Analytical Letters, rok: 2005, ročník: 38, vydání: 3
-
Počítačové modelování a simulace - nové technologie při vývoji prostředkůproti chemickým bojovým látkám
Voj. zdrav. listy, rok: 2005, ročník: roč. 74, vydání: 5/6
-
Polyphasic taxonomic study of strain CCM2783 resulting in description of Arthrobacter stackebrandtii sp. nov.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, rok: 2005, ročník: 55/2005, vydání: 2
-
Praktické aspekty absolutní kvantifikace proteinů a peptidů pomocí MS
3. ročník Školy HPLC/MS - Sborník přednášek, rok: 2005
-
Preliminary study on the monitoring of glutathione S-tranferase activity toward styrene oxide by electromigration methods
Journal of Separation Science, rok: 2005, ročník: 28, vydání: 12
-
Proteomic analysis of iron and sulfur oxidizing Acidithiobacillus ferrooxidans using immobilized pH gradients and mass spectrometry
Rok: 2005, druh: Konferenční abstrakty
-
Purification and some new kinetic parameters of FerB enzyme from Paracoccus denitrificans
ChemZi, rok: 2005
-
Quartz crystal biosensor for detection of sugars and glycated hemoglobin
Analytica Chimica Acta, rok: 2005, ročník: 530, vydání: 1