Informace o projektu
Multidisciplinární přístup k návrhu léčiv - Inhibice proteinů s návazností na sacharidy
(MADICA)
- Kód projektu
- LH13055
- Období řešení
- 3/2013 - 12/2015
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- KONTAKT II (od projektů s počátkem řešení v roce 2011)
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Michaela Wimmerová, Ph.D.
- Mgr. Gita Paulíková, Ph.D.
Existuje několik možných přístupů k drug designu. Velmi častou cílovou látkou jsou enzymy, ale může to být také nukleová kyselina či dokonce ribosom. Mezi nové typy léčiv patří také ta, která jsou založena na napodobení molekul sacharidů. Cílem jsou dvě skupiny proteinů uplatňujících se v infekčních a nádorových onemocněních, a to mono a oligosacharidy rozpoznávající proteiny (lektiny z patogenů) a enzymy oligosacharidy syntetizující (patogenní a lidské glykosytransferasy). Smysl a síla česko-americké spolupráce spočívá v kombinaci komplementární expertízy české strany v oblasti glykobiochemie a výpočetní chemie a americké strany v obecné oblasti návrhu léčiv.
Publikace
Počet publikací: 23
2014
-
Differences among binding sites of AAL family lectins - High affinity vs. high specificity of sugar binding
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
Engineering the Pseudomonas aeruginosa II lectin: designing mutants with changed affinity and specificity
Journal of Computer-Aided Molecular Design, rok: 2014, ročník: 28, vydání: 9, DOI
-
Exploring the Reaction Mechanism of O-GlcNAc Transferase using QM/MM Molecular Dynamics
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
MotiveValidator: interactive web-based validation of ligand and residue structure in biomolecular complexes
Nucleic Acids Research, rok: 2014, ročník: 42, vydání: W1, DOI
-
MotiveValidator: software for validation of ligand and residue structures in biomolecular complexes
Rok: 2014
-
QM/MM Molecular Dynamics Study of the O-GlcNAc Transferase Reaction Mechanism
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
RSL lectin - a complex approach to study carbohydrate-protein interaction
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
Structural and functional characterization of Ralstonia solanacearum lectin mutant
Rok: 2014, druh: Konferenční abstrakty
-
ValidatorDB: database of validation results for ligands and non-standard residues from the Protein Data Bank
Rok: 2014
2013
-
A Soluble Fucose-Specific Lectin from Aspergillus fumigatus Conidia - Structure, Specificity and Possible Role in Fungal Pathogenicity
PLOS ONE, rok: 2013, ročník: 8, vydání: 12, DOI