Informace o projektu
Strukturní a funkční komponenty rostlinných telomer
- Kód projektu
- GA13-06943S
- Období řešení
- 3/2013 - 12/2017
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Eva Sýkorová, CSc.
Telomery jsou nukleoproteinové struktury na koncích eukaryotických chromosomů, které jsou udržovány aktivitou komplexu telomerázy. Předkládaný projekt v sobě zahrnuje komplexní studie (1) proteinové struktury a interakcí rostlinných telomer, (2) regulace komplexu telomerázy a (3) evoluce struktury genu TERT kódujícího proteinovou podjednotku telomerázy. Proteiny účastnící se tvorby funkčního
komplexu rostlinné telomery budou identifikovány kombinací vysokokapacitních proteomických přístupů s využitím modelových rostlin s různou délkou telomer – Nicotiana tabacum a Arabidopsis thaliana. Kandidátní proteiny budou následně charakterizovány pomocí T-DNA inzerčních linií A. thaliana a jejich interakce (DNA-protein, protein-protein) s komponenty telomer budou zkoumány pomocí klasických molekulárně-biologických in vitro metod. Studie evoluce struktury telomerázového genu bude rozšířena o polyploidní druhy z rodu Nicotiana a čeledi Solanaceae. Očekávané výstupy projektu přispějí k detailnímu pochopení způsobů a regulace udržování telomer.
Publikace
Počet publikací: 10
2017
-
Tandem affinity purification of AtTERT reveals putative interaction partners of plant telomerase in vivo
Protoplasma, rok: 2017, ročník: 254, vydání: 4, DOI
-
Tissue-specific expression of telomerase reverse transcriptase gene variants in Nicotiana tabacum
Planta, rok: 2017, ročník: 245, vydání: 3, DOI
2016
-
Telomere- and Telomerase-Associated Proteins and Their Functions in the Plant Cell
Frontiers in Plant Science, rok: 2016, ročník: 7, vydání: June, DOI
-
Telomere binding protein TRB1 is associated with promoters of translation machinery genes in vivo
Plant Molecular Biology, rok: 2016, ročník: 90, vydání: 1-2, DOI
2015
-
cDNA Library Screening Identifies Protein Interactors Potentially Involved in Non-Telomeric Roles of Arabidopsis Telomerase
Frontiers in Plant Science, rok: 2015, ročník: 6, vydání: November, DOI
-
Centromere and telomere sequence alterations reflect the rapid genome evolution within the carnivorous plant genus Genlisea
Plant Journal, rok: 2015, ročník: 84, vydání: 6, DOI
-
Holokinetic centromeres and efficient telomere healing enable rapid karyotype evolution
Chromosoma, rok: 2015, ročník: 124, vydání: 4, DOI
-
Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes
The Plant Journal, rok: 2015, ročník: 83, vydání: 1, DOI
-
Terminal Restriction Fragments (TRF) Method to Analyze Telomere Lengths
Bio-protocol, rok: 2015, ročník: 5, vydání: 23, DOI
2014
-
Telomere repeat binding proteins are functional components of Arabidopsis telomeres and interact with telomerase
The Plant Journal, rok: 2014, ročník: 77, vydání: 5, DOI