Informace o projektu
THALAssaemia MOdular Stratification System for personalized therapy of beta-thalassemia
(THALAMOSS)
- Kód projektu
- 7E13011
- Období řešení
- 1/2013 - 10/2016
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Podpora projektů sedmého rámcového programu Evropského společenství pro výzkum, technologický rozvoj a demonstrace (2007 až 2013)
- Fakulta / Pracoviště MU
- Ústav výpočetní techniky
- Další fakulta/pracoviště MU
- Fakulta informatiky
THALAMOSS si klade za cíl zajistit podrobné informace o vztahu genotypu a fenotypu u β-thalassaemie za hranicí efektů primárních mutací a velkých modifikátorů závažnosti nemoci. THALAMOSS jako první sesbírá a zanalyzuje dohromady data ze čtyř mezinárodních lékařských center ohledně charakteristik pacientů a souvisejících molekulárních dat, možné reakce na léčbu a kritické aspekty léčebných režimů. Korelace současných léčebných postupů, zahrnující transfúze krve, splenectomii a chelační terapii s dalšími studovanými parametry a s medicínskými indikátory kvality života pacientů povede k budoucím předpovědím optimální léčby a postupu nemoci specificky pro každého pacienta. Masarykova univerzita se na projektu bude podílet ve dvou oblastech: (1) vývoj nástrojů pro správu dat a jejich zpracování, (2) zpracování genomových dat a bioinformatické analýzy.
Publikace
Počet publikací: 5
2016
-
Semi-automatic mining of correlated data from a complex database: Correlation network visualization
Computational Advances in Bio and Medical Sciences (ICCABS), 2016 IEEE 6th International Conference on, rok: 2016
2015
-
A flexible denormalization technique for data analysis above a deeply-structured relational database: biomedical applications
Lecture Notes in Computer Science 9043, Bioinformatics and Biomedical Engineering, Third International Conference, IWBBIO 2015, Granada, Spain, April 15-17 2015, Proceedings, Part I, rok: 2015
2014
-
The possibilities of using biological knowledge for filtering pairs of SNPs in GWAS studies: an exploratory study on public protein-interaction and pathway data.
Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms, rok: 2014
2013
-
Generovanie simulovaných testovacích dát pre genómové asociačné štúdie
ITAT 2013: Information Technologies - Applications and Theory (Workshops, Posters, and Tutorials), rok: 2013
-
THALAMOSS Data Management Platform
Rok: 2013