Informace o projektu
Evoluce, diversifikace a biogeografie polyploidní čeledi Zingiberaceae: synergie fylogenomiky, cytogenomiky, geologické a klimatické historie
- Kód projektu
- GA14-13541S
- Období řešení
- 1/2014 - 12/2016
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Univerzita Karlova
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
Zázvorovité (Zingiberaceae) jsou ekonomicky významnou tropickou čeledí rostlin rozšířenou především v jihovýchodní Asii a částečně v Africe a jižní Americe zahrnující přibližně 50 rodů. Aplikací moderních NGS fylogenomických technik (tzv. hybridization-based enrichment a genome skimming) budou získány sekvence celých chloroplastů a několika stovek jaderných genů pro stovky druhů, které budou použity pro vytvoření robustní a dobře rozlišené fylogeneze čeledi. Ta bude kalibrována pomocí fosilního záznamu. Kombinace získané genomické informace a cytogenomické údaje budou použity pro odhad počtu a datování polyploidizačních událostí během evoluce. Kalibrovaná fylogeneze také umožní rekonstruovat vývoj biogeografického pattern zázvorovitých.