![Důležité termíny](https://cdn.muni.cz/media/3716855/image_2.jpg?mode=crop¢er=0.5,0.5&rnd=133667368190000000&heightratio=0.5&width=278)
Informace o projektu
Biomolekulární centrum
- Kód projektu
- LC06030
- Období řešení
- 3/2006 - 12/2011
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR
- Centra základního výzkumu
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- prof. RNDr. Vladimír Sklenář, DrSc.
- Klíčová slova
- léčiva proti rakovině, biosenzory, lektiny, počítačové modelování biomolekul, biomolekulární NMR
- Spolupracující organizace
-
Biofyzikální ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Jiří Šponer, DrSc.
- Odpovědná osoba doc. RNDr. Ivan Rychlík, Ph.D.
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Výsledky
Klíčovým motivem projektu je posunout strukturní biologii v ČR z úrovně studia jednotlivých biomakromolekul na úroveň studia jejich komplexů. To bude uskutečněno jednak implementací nejmodernějších trendů ve vybraných metodách v této oblasti (NMR spektroskopie, počítačové modelování), jednak orientací na problémy, které stojí v popředí zájmu současných věd o živých systémech. K nim patří studium klíčových buněčných procesů jako je udržení stability genomu a oprava DNA, syntéza bílkovin v ribosomu či přenos informace prostřednictvím rozpoznávání (lektiny). Vybrané směry výzkumu budou dovedeny do bioanalytických (biosensory) či biomedicinálních (vakcíny, chemoterapeutika) závěrů vhodných jako východiska pro aplikovaný výzkum a vývoj. Dosažení cíle projektu není možné pouze v jediné ze zakládajících organizací Centra, je třeba spolupráce všech partnerů. U řady jednotlivých dílčích cílů bude vyžadována i spolupráce zahraniční.
Publikace
Počet publikací: 284
2011
-
Interpretation of substituent effects on 13C and 15N NMR chemical shifts in 6-substituted purines
Physical Chemistry Chemical Physics, rok: 2011, ročník: 13, vydání: 35, DOI
-
Natural Compound Cudraflavone B Shows Promising Anti-inflammatory Properties in Vitro
Journal of Natural Products, rok: 2011, ročník: 74, vydání: 4, DOI
-
NMR cross-correlated relaxation rates reveal ion coordination sites in DNA
Journal of the American Chemical Society, rok: 2011, ročník: 133, vydání: 35, DOI
-
NMR study of an RNA polymerase subunit unique for gram-positive bacteria
Rok: 2011, druh: Další prezentace na konferencích
-
Noncanonical Hydrogen Bonding in Nucleic Acids. Benchmark Evaluation of Key Base-Phosphate Interactions in Folded RNA Molecules Using Quantum-Chemical Calculations and Molecular Dynamics Simulations
JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY A, rok: 2011, ročník: 115, vydání: 41, DOI
-
pKa Calculation for Selected Active Site Residues in Acetylcholinesterase
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
PMFLib – A TOOLKIT FOR FREE ENERGY CALCULATIONS II
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty
-
Predicting pK(a) values of substituted phenols from atomic charges: Comparison of different quantum mechanical methods and charge distribution schemes
Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2011, ročník: 51, vydání: 8
-
Predicting pKa values of substituted phenols from atomic charges.
Rok: 2011, druh: Konferenční abstrakty