Informace o projektu
Chybějící souvislosti: evoluce genomu v tribu Camelineae (brukvovité)
- Kód projektu
- GA17-13029S
- Období řešení
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
Tribus Camelineae (CAMEL; 32 druhů, 8 rodů), obsahující modelový rod Arabidopsis, je z vědeckého hlediska nejdůležitější skupinou brukvovitých (Brassicaceae). Vedle několika modelových druhů, tento tribus také zahrnuje významné plevelné druhy a sekvenovaný genom lničky seté (Camelina sativa; aktraktivní zdroj biopaliv). Navzdory své potenciální důležitosti, genomy několika druhů tribu CAMEL zůstávají neprozkoumány nebo jsou zcela neznámé. O vzniku a evoluci těchto přehlížených genomů existuje překvapivě málo informací. Cílem našeho projektu je charakterizovat chybějící souvislosti mezi dobře známými i neznámými CAMEL genomy prostřednictvím rekonstrukce evoluce genomu v tribu CAMEL i blízce příbuzných tribech. S použitím srovnávacích cytogenomických a fylogenetických přístupů plánujeme (re)konstruovat srovnávací cytogenomické mapy a ancestrální genomy, identifikovat mechanismy genomových přestaveb, a rekonstruovat fylogenetickou strukturu a postavení tribu CAMEL. Naše výsledky by měly inciovat trnaslační výzkum, etablování nových modelových druhů a celogenomové sekvenační projekty.
Publikace
Počet publikací: 6
2021
-
Parallelism in gene expression between foothill and alpine ecotypes in Arabidopsis arenosa
Plant Journal, rok: 2021, ročník: 105, vydání: 5, DOI
2019
-
Camelina neglecta (Brassicaceae, Camelineae), a new diploid species from Europe
PHYTOKEYS, rok: 2019, ročník: JAN, vydání: 115, DOI
-
Genome invasion by a hypomethylated satellite repeat in Australian crucifer Ballantinia antipoda
Plant Journal, rok: 2019, ročník: 99, vydání: 6, DOI
-
Healthy Roots and Leaves: Comparative Genome Structure of Horseradish and Watercress
Plant Physiology, rok: 2019, ročník: 179, vydání: 1, DOI
-
Origin and Evolution of Diploid and Allopolyploid Camelina Genomes Were Accompanied by Chromosome Shattering
Plant Cell, rok: 2019, ročník: 31, vydání: 11, DOI
-
The story of promiscuous crucifers: origin and genome evolution of an invasive species, Cardamine occulta (Brassicaceae), and its relatives
Annals of Botany, rok: 2019, ročník: 124, vydání: 2, DOI