Informace o projektu
Post-polyploid genome evolution in Microlepidieae species (Brassicaceae)
- Kód projektu
- GJ20-03419Y
- Období řešení
- 1/2020 - 12/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Juniorské granty
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Středoevropský technologický institut
- Xinyi Guo, PhD
- Šarlota Štemberová
- Sheng Zuo, Ph.D.
We propose to investigate the process of post-polyploid genome evolution in Microlepidieae species. In particular, we intend to:
1) generate genome and transcriptome assemblies for selected Microlepidieae and parental species,
2) partition each reshuffled allotetraploid genomes into two homeologous subgenomes,
3) reveal patterns gene fractionation and subgenome dominance during diploidization,
4) elucidate the dynamics of transposable elements and small-scale genomic variations,
5) clarify the relationship between MICR species and the unplaced genera of Dipoma and Hemiophia,
6) estimate the timing of tetraploidization event(s).
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 3
2022
-
Genome diploidization associates with cladogenesis, trait disparity, and plastid gene evolution
PLANT PHYSIOLOGY, rok: 2022, ročník: 190, vydání: 1, DOI
-
Transfer of two Arabidella and two Cuphonotus species to the genus Lemphoria (Brassicaceae) and a description of the new species L. queenslandica
Phytotaxa, rok: 2022, ročník: 549, vydání: 2, DOI
2021
-
Linked by Ancestral Bonds: Multiple Whole-Genome Duplications and Reticulate Evolution in a Brassicaceae Tribe
Molecular Biology and Evolution, rok: 2021, ročník: 38, vydání: 5, DOI