Informace o projektu
Pokročilé sekvenační metody pro analýzu strukturních přestaveb nádorového genomu
- Kód projektu
- NU21-08-00237
- Období řešení
- 5/2021 - 12/2025
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Program na podporu zdravotnického aplikovaného výzkumu na léta 2020 - 2026
- Podprogram 1 - standardní
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Fakultní nemocnice Brno
Moderní metody sekvenování DNA umožňují podrobné mapování nádorového genomu a identifikaci lézí, na něž je možné cílit protinádorovou léčbu. Sekvenování pomocí dlouhého čtení dovoluje charakterizovat přestavby genomu, které je obtížné přesně určit pomocí standardních metod nádorové cytogenetiky. Ve skupině pacientů s hematoonkologickými diagnózami chceme využít nové sekvenační metody pro zjištění organizace genomu a rekurentních přestaveb s cílem pochopit mechanismy vzniku aberací a určit jejich význam pro klinický průběh nemoci a odpověď na léčbu.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 36
2024
-
The non-canonical BAF chromatin remodeling complex is a novel target of spliceosome dysregulation in SF3B1-mutated chronic lymphocytic leukemia
Leukemia, rok: 2024, DOI
2023
-
A web-based bioinformatic tool LYNX for targeted LYmphoid NeXt- generation sequencing data analysis and visualization for hematooncology.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Application of long-read sequencing for detection of complex chromosomal rearrangements.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Application of long-read sequencing in chronic lymphocytic leukemia cases with complex karyotype.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
CLLue: Searching for connections among clinical, biological, and molecular features in the dataset of leukemia patients.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Clonal competition and disrupted molecular processes in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Exploring patterns in clinical, biological, and molecular data of leukemia patients with CLLue.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Chromatin conformation analysis reveals genome structural and functional complexity in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Resolving chromatin organization in chronic lymphocytic leukemia.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Solving complex karyotypes in leukemia samples using long-read sequencing.
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty