Informace o projektu
Fázová separace kapalina-kapalina a přirozená neuspořádanost proteinů v bakteriální transkripci
- Kód projektu
- GA25-16037S
- Období řešení
- 1/2025 - 12/2027
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Libor Krásný, Ph.D.
- Odpovědná osoba Mgr. Tomáš Kovaľ, Ph.D.
Výsledkem separace bílkovin v kapalné fázi (LLPS) jsou kondenzáty, které hrají v buňce
klíčovou roli. LLPS často závisí na vnitřně neuspořádaných proteinech. O LLPS u bakterií je
známo velmi málo. Nedávno jsme pozorovali neočekávanou LLPS u částečně neuspořádaného
mykobakteriálního faktoru sigma (SigA, podjednotka RNAP) in vitro. To naznačuje, že bakterie
může využívat LLPS k organizaci svého transkripčního aparátu. Dále jsme identifikovali dosud
neznámý transkripční faktor (UCP7) ze stejné bakterie složený ze strukturovaných a neuspořádaných částí. Navrhujeme prozkoumat význam LLPS v bakteriální transkripci s využitím Mycobacterium smegmatis jako modelového systému. Popíšeme dynamiku proteinů
SigA a UCP7 a charakterizujeme jejich schopnost tvořit LLPS. Definujeme role jejich
nestrukturovaných částí v transkripci. Celkově pak projekt poskytne komplexní model fungování
nestrukturovaných částí bakteriálního transkripčního aparátu a odhalí, zda/jak LLPS ovlivňuje
expresi prokaryotických genů.