Informace o projektu
Srovnání mikrobiologických numerických identifikačních metod

Kód projektu
EP0960976537
Období řešení
1/1996 - 1/1997
Investor / Programový rámec / typ projektu
Ministerstvo zemědělství ČR
Fakulta / Pracoviště MU
Přírodovědecká fakulta
Spolupracující organizace
Výzkumný ústav pro chov skotu

Cílem předkládaného projektu je srovnat a vyhodnotit identifikační metody, používané v bakteriální taxonomii. Předpokládáme srovnání následujících metod : identifikační skóre (Wilcox, Lapage), modální podíl pravděpodobnosti (Dybowski a Franklin), T-index (Boeufgrass et al), relativní pravděpodobnost (Friedmann a MacLowry), taxonomická vzdálenost (Gyllenberg), metoda poloměru taxonu (Sneath), metoda limitu absolutní pravděpodobnosti (Gyllenberg a Niemela). Pro srovnání uvedených metod budou použity frekvenční identifikační matice, vytvořené Českou sbírkou mikroorganismů pro potřeby rutinních identifikací enterobaktérií, nefermentujících baktérií, stafylokoků a mikrokoků, enterokoků a streptokoků, anaerobních baktérií a vibrií. Nebudou tedy použity datové matice údajů jednotlivých kmenů. Pro práci předpokládáme použití třech typů testovaných dat : (1) Tzv. "ideální zástupce" jednotlivých taxonů, získané jednoduchou extrakcí z identifikačních matic, (2) sbírkové kmeny s ověřenou identitou.

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info