A Benchmark for Comparison of Cell Tracking Algorithms

• Autoři: MAŠKA Martin; ULMAN Vladimír; SVOBODA David; MATULA Pavel; MATULA Petr; EDERRA Cristina; URBIOLA Ainhoa; ESPANA Tomás; VENKATESAN Subramanian; BALAK Deepak M W; KARAS Pavel; BOLCKOVÁ Tereza; ŠTREITOVÁ Markéta; CARTHEL Craig; CORALUPPI Stefano; HARDER Nathalie; ROHR Karl; MAGNUSSON Klas E G; JALDÉN Joakim; BLAU Helen M; DZYUBACHYK Oleh; KŘÍŽEK Pavel; HAGEN Guy M; PASTOR-ESCUREDO David; JIMENEZ-CARRETERO Daniel; LEDESMA-CARBAYO Maria J; MUNOZ-BARRUTIA Arrate; MEIJERING Erik; KOZUBEK Michal; ORTIZ-DE-SOLORZANO Carlos
• Rok publikování: 2014
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Bioinformatics
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• www: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu080
• Doi: http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btu080
• Obor: Informatika
• Klíčová slova: cell tracking; fluorescence microscopy
• Popis: Automatic tracking of cells in multidimensional time-lapse fluorescence microscopy is an important task in many biomedical applications. A novel framework for objective evaluation of cell tracking algorithms has been established under the auspices of the IEEE International Symposium on Biomedical Imaging 2013 Cell Tracking Challenge. In this article, we present the logistics, datasets, methods and results of the challenge and lay down the principles for future uses of this benchmark.

Související projekty

• Dynamika a organizace chromosomů během buněčného cyklu a při diferenciaci v normě a patologii
• Zaměstnáním čerstvých absolventů doktorského studia k vědecké excelenci