Informace o publikaci
NMR Distance Restraints At Low Temperatures : An Application to DNA Hairpin.
| Název česky | Extrakce NMR dat s využitím nízkoteplotních měření : Aplikace metody pro DNA hairpin. |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2004 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 19th NMR Valtice : Central European NMR Discussion Groups |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | NMR;DNA;structure |
| Popis | Krátké DNA oligonukleotidy hrají významnou úlohu v mnohých biologických procesech. Nejzajímavějsí vlastností hairpinů s obecnou sekvencí d(GCGNAGC) (N=A,G,C,T) je jejich výjimečná stabilita, reprezentovaná vysokou teplotou tání hairpinů, jejich zvýšenou mobilitou u PAGE elektroforézy a odolností vůči nukleázám. Proto poznáním a studiem jejich struktur můžeme lépe porozumět i jejich výjimečnému chování. Struktura jednoho z těchto oligonukleotidů, d(GCGAAGC), byla nedávno vyřešena pomocí NMR spektroskopie s využitím meziprotonových vzdáleností získaných z NOESY spekter, torzních úhlů i zbytkových dipolárních interakcí. Cílem teto studie byl výpočet struktury zmíněného hairpinu d(GCGAAGC) s využitím dat získaných z NOESY spekter, změřených při teplotě pod 273K. Při této teplotě dochází k potlačení chemické výměny i intramolekulárních pohybů, čímž lze získat více dat potrebných pro následné řešení struktury molekuly. |
| Související projekty: |