CICADA: Parallelization and Related Problems

• Název česky: CICADA: Parallelizace a přidružené problémy
• Autoři: KOSINA Aleš; KŘÍŽ Zdeněk; KOČA Jaroslav
• Rok publikování: 2005
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Workshop on Modeling Interactions in Biomolecules II
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Biochemie
• Klíčová slova: Single Coordinate Driving; Parallelization; Conformational Analysis; result verification
• Popis: Program CICADA je postaven na SCD (Single Coordinate Driving) přístupu a je používán pro konformační analýzu malých a středních molekula a pro molekulární docking. Program CICADA byl paralelizován pomocí Master-Slave přístupu. Program byl velmi intenzivně testován na různých výpočetních prostředích a výsledky ukazují nezávislot výpočtů na použitém prostředí a počtu procesorů.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu