Optimalizace izolace bakteriální DNA amplifikovatelné v PCR

• Autoři: NĚMCOVÁ Petra; ŠPANOVÁ Alena; RITTICH Bohuslav; HORÁK Daniel
• Rok publikování: 2006
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: X. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Mikrobiologie, virologie
• Klíčová slova: DNA; magnetic particles; Lactobacillus; PCR
• Popis: Byl optimalizován postup izolace bakteriální DNA pomocí magnetických částic P(HEMA-co-GMA) (1/1) pokrytých karboxylovými skupinami (0,764 mM COOH/g ). Jako kontrola byly použity magnetické částice silikagelu (CPG, USA). Adsorpce DNA probíhala v prostředí vysoké koncentrace PEG 6000 a NaCl. K testování byla použita DNA izolovaná z bakterií rodu Lactobacillus narostlých v čisté kultuře. Při eluci DNA z částic bylo ověřováno použití různých pufrů (voda, TE, TBE a TAE pufr), doby eluce a způsobů promíchávání částic. Nejvhodnější postup byl použit při izolaci DNA z bakterií rodu Lactobacillus obsažených v mléčných výrobcích. Bakterie rodu Lactobacillus byly identifikovány pomocí PCR s rodově specifickými primery LbLMA 1-rev a R16-1 (Dubernet a spol., 2002). Druh Lactobacillus acidophilus byl identifikován pomocí PCR s druhově specifickými primery Aci I a Aci II (Tilsala a kol., 1997).

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Magnetické hydrofilní polymerní mikročástice reagující na vnější stimuly pro lékařství a bioinženýrství
• Aplikace molekulárně biologických metod pro efektivní využití genetických zdrojů BMK a pro charakterizaci kvality funkčních potravin